Protein–RNA interactions for Protein: P97468

Cmklr1, Chemokine-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmklr1P97468 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cmklr1P97468 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cmklr1P97468 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cmklr1P97468 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cmklr1P97468 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cmklr1P97468 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cmklr1P97468 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cmklr1P97468 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cmklr1P97468 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cmklr1P97468 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cmklr1P97468 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cmklr1P97468 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cmklr1P97468 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cmklr1P97468 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cmklr1P97468 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cmklr1P97468 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cmklr1P97468 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cmklr1P97468 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cmklr1P97468 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cmklr1P97468 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cmklr1P97468 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cmklr1P97468 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cmklr1P97468 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cmklr1P97468 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cmklr1P97468 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cmklr1P97468 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cmklr1P97468 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cmklr1P97468 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cmklr1P97468 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cmklr1P97468 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cmklr1P97468 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cmklr1P97468 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cmklr1P97468 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cmklr1P97468 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cmklr1P97468 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cmklr1P97468 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cmklr1P97468 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cmklr1P97468 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cmklr1P97468 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cmklr1P97468 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cmklr1P97468 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cmklr1P97468 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cmklr1P97468 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cmklr1P97468 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cmklr1P97468 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cmklr1P97468 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cmklr1P97468 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cmklr1P97468 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cmklr1P97468 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cmklr1P97468 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cmklr1P97468 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cmklr1P97468 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cmklr1P97468 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cmklr1P97468 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cmklr1P97468 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cmklr1P97468 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cmklr1P97468 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cmklr1P97468 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cmklr1P97468 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cmklr1P97468 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cmklr1P97468 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cmklr1P97468 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cmklr1P97468 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cmklr1P97468 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cmklr1P97468 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cmklr1P97468 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cmklr1P97468 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cmklr1P97468 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cmklr1P97468 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmklr1P97468 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmklr1P97468 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmklr1P97468 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmklr1P97468 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmklr1P97468 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmklr1P97468 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmklr1P97468 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmklr1P97468 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmklr1P97468 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmklr1P97468 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmklr1P97468 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmklr1P97468 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmklr1P97468 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmklr1P97468 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmklr1P97468 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmklr1P97468 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmklr1P97468 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmklr1P97468 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmklr1P97468 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmklr1P97468 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmklr1P97468 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmklr1P97468 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmklr1P97468 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmklr1P97468 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmklr1P97468 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmklr1P97468 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cmklr1P97468 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cmklr1P97468 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cmklr1P97468 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cmklr1P97468 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cmklr1P97468 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms