Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Psme1P97371 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Psme1P97371 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Psme1P97371 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Psme1P97371 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Psme1P97371 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Psme1P97371 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Psme1P97371 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Psme1P97371 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Psme1P97371 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Psme1P97371 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Psme1P97371 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Psme1P97371 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Psme1P97371 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Psme1P97371 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Psme1P97371 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Psme1P97371 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Psme1P97371 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Psme1P97371 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Psme1P97371 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Psme1P97371 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Psme1P97371 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Psme1P97371 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Psme1P97371 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Psme1P97371 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Psme1P97371 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Psme1P97371 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Psme1P97371 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Psme1P97371 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Psme1P97371 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Psme1P97371 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Psme1P97371 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Psme1P97371 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Psme1P97371 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Psme1P97371 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Psme1P97371 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Psme1P97371 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Psme1P97371 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Psme1P97371 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Psme1P97371 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Psme1P97371 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Psme1P97371 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Psme1P97371 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Psme1P97371 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Psme1P97371 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Psme1P97371 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Psme1P97371 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Psme1P97371 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Psme1P97371 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Psme1P97371 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Psme1P97371 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Psme1P97371 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Psme1P97371 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Psme1P97371 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Psme1P97371 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Psme1P97371 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Psme1P97371 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Psme1P97371 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Psme1P97371 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Psme1P97371 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Psme1P97371 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Psme1P97371 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Psme1P97371 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Psme1P97371 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Psme1P97371 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Psme1P97371 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Psme1P97371 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Psme1P97371 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Psme1P97371 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Psme1P97371 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Psme1P97371 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Psme1P97371 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Psme1P97371 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Psme1P97371 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Psme1P97371 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Psme1P97371 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Psme1P97371 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Psme1P97371 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Psme1P97371 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Psme1P97371 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Psme1P97371 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Psme1P97371 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Psme1P97371 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Psme1P97371 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Psme1P97371 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Psme1P97371 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Psme1P97371 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Psme1P97371 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Psme1P97371 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Psme1P97371 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Psme1P97371 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Psme1P97371 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Psme1P97371 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Psme1P97371 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Psme1P97371 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Psme1P97371 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Psme1P97371 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Psme1P97371 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Psme1P97371 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Psme1P97371 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms