Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snap25P60879 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snap25P60879 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snap25P60879 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snap25P60879 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snap25P60879 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snap25P60879 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snap25P60879 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snap25P60879 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snap25P60879 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snap25P60879 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snap25P60879 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snap25P60879 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snap25P60879 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snap25P60879 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snap25P60879 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snap25P60879 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snap25P60879 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snap25P60879 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snap25P60879 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snap25P60879 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snap25P60879 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snap25P60879 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snap25P60879 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snap25P60879 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Snap25P60879 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snap25P60879 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snap25P60879 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snap25P60879 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snap25P60879 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snap25P60879 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snap25P60879 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snap25P60879 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snap25P60879 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snap25P60879 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snap25P60879 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snap25P60879 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snap25P60879 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snap25P60879 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snap25P60879 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Snap25P60879 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snap25P60879 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Snap25P60879 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snap25P60879 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snap25P60879 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snap25P60879 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snap25P60879 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snap25P60879 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snap25P60879 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snap25P60879 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snap25P60879 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snap25P60879 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snap25P60879 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snap25P60879 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snap25P60879 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Snap25P60879 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snap25P60879 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snap25P60879 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snap25P60879 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snap25P60879 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snap25P60879 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snap25P60879 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snap25P60879 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snap25P60879 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snap25P60879 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snap25P60879 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snap25P60879 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snap25P60879 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snap25P60879 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snap25P60879 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snap25P60879 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snap25P60879 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snap25P60879 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Snap25P60879 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snap25P60879 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snap25P60879 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snap25P60879 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snap25P60879 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snap25P60879 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Snap25P60879 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snap25P60879 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Snap25P60879 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snap25P60879 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snap25P60879 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snap25P60879 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snap25P60879 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snap25P60879 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snap25P60879 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snap25P60879 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snap25P60879 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snap25P60879 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snap25P60879 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snap25P60879 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snap25P60879 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snap25P60879 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Snap25P60879 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Snap25P60879 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snap25P60879 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snap25P60879 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snap25P60879 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms