Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Samsn1P57725 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Samsn1P57725 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Samsn1P57725 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Samsn1P57725 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Samsn1P57725 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Samsn1P57725 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Samsn1P57725 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Samsn1P57725 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Samsn1P57725 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Samsn1P57725 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Samsn1P57725 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Samsn1P57725 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Samsn1P57725 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Samsn1P57725 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Samsn1P57725 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Samsn1P57725 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Samsn1P57725 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Samsn1P57725 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Samsn1P57725 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Samsn1P57725 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Samsn1P57725 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Samsn1P57725 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Samsn1P57725 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Samsn1P57725 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Samsn1P57725 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Samsn1P57725 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Samsn1P57725 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Samsn1P57725 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Samsn1P57725 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Samsn1P57725 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Samsn1P57725 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Samsn1P57725 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Samsn1P57725 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Samsn1P57725 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Samsn1P57725 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Samsn1P57725 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Samsn1P57725 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Samsn1P57725 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Samsn1P57725 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Samsn1P57725 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Samsn1P57725 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Samsn1P57725 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Samsn1P57725 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Samsn1P57725 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Samsn1P57725 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Samsn1P57725 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Samsn1P57725 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Samsn1P57725 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Samsn1P57725 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Samsn1P57725 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Samsn1P57725 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Samsn1P57725 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Samsn1P57725 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Samsn1P57725 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Samsn1P57725 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Samsn1P57725 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Samsn1P57725 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Samsn1P57725 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Samsn1P57725 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Samsn1P57725 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Samsn1P57725 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Samsn1P57725 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Samsn1P57725 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Samsn1P57725 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Samsn1P57725 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Samsn1P57725 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Samsn1P57725 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Samsn1P57725 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Samsn1P57725 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Samsn1P57725 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Samsn1P57725 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Samsn1P57725 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Samsn1P57725 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Samsn1P57725 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Samsn1P57725 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Samsn1P57725 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Samsn1P57725 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Samsn1P57725 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Samsn1P57725 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Samsn1P57725 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Samsn1P57725 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Samsn1P57725 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Samsn1P57725 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Samsn1P57725 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Samsn1P57725 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Samsn1P57725 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Samsn1P57725 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Samsn1P57725 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Samsn1P57725 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Samsn1P57725 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Samsn1P57725 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Samsn1P57725 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Samsn1P57725 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Samsn1P57725 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Samsn1P57725 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Samsn1P57725 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Samsn1P57725 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Samsn1P57725 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Samsn1P57725 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms