Protein–RNA interactions for Protein: P53996

Cnbp, Cellular nucleic acid-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnbpP53996 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CnbpP53996 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CnbpP53996 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CnbpP53996 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CnbpP53996 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CnbpP53996 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CnbpP53996 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CnbpP53996 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CnbpP53996 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CnbpP53996 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
CnbpP53996 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CnbpP53996 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CnbpP53996 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CnbpP53996 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CnbpP53996 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CnbpP53996 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CnbpP53996 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CnbpP53996 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CnbpP53996 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CnbpP53996 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CnbpP53996 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CnbpP53996 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CnbpP53996 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CnbpP53996 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CnbpP53996 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CnbpP53996 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CnbpP53996 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CnbpP53996 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CnbpP53996 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CnbpP53996 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CnbpP53996 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CnbpP53996 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CnbpP53996 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CnbpP53996 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CnbpP53996 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CnbpP53996 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CnbpP53996 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CnbpP53996 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CnbpP53996 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CnbpP53996 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CnbpP53996 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CnbpP53996 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CnbpP53996 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms