Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fgd1P52734 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fgd1P52734 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Fgd1P52734 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Fgd1P52734 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Fgd1P52734 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Fgd1P52734 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fgd1P52734 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fgd1P52734 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fgd1P52734 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fgd1P52734 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fgd1P52734 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fgd1P52734 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fgd1P52734 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fgd1P52734 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fgd1P52734 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fgd1P52734 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fgd1P52734 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fgd1P52734 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fgd1P52734 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fgd1P52734 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fgd1P52734 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fgd1P52734 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fgd1P52734 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fgd1P52734 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fgd1P52734 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fgd1P52734 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Fgd1P52734 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fgd1P52734 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fgd1P52734 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fgd1P52734 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fgd1P52734 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fgd1P52734 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fgd1P52734 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fgd1P52734 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fgd1P52734 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fgd1P52734 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Fgd1P52734 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fgd1P52734 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fgd1P52734 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fgd1P52734 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fgd1P52734 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fgd1P52734 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fgd1P52734 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fgd1P52734 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fgd1P52734 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fgd1P52734 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fgd1P52734 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fgd1P52734 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fgd1P52734 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fgd1P52734 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Fgd1P52734 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fgd1P52734 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fgd1P52734 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Fgd1P52734 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fgd1P52734 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fgd1P52734 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fgd1P52734 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fgd1P52734 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fgd1P52734 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fgd1P52734 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fgd1P52734 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fgd1P52734 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fgd1P52734 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fgd1P52734 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Fgd1P52734 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fgd1P52734 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fgd1P52734 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fgd1P52734 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fgd1P52734 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fgd1P52734 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fgd1P52734 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fgd1P52734 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fgd1P52734 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Fgd1P52734 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Fgd1P52734 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fgd1P52734 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fgd1P52734 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fgd1P52734 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fgd1P52734 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fgd1P52734 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fgd1P52734 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fgd1P52734 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fgd1P52734 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fgd1P52734 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fgd1P52734 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Fgd1P52734 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fgd1P52734 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fgd1P52734 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fgd1P52734 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fgd1P52734 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fgd1P52734 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fgd1P52734 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fgd1P52734 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fgd1P52734 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fgd1P52734 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fgd1P52734 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fgd1P52734 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fgd1P52734 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fgd1P52734 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms