Protein–RNA interactions for Protein: P48432

Sox2, Transcription factor SOX-2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox2P48432 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sox2P48432 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sox2P48432 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sox2P48432 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox2P48432 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox2P48432 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox2P48432 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox2P48432 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox2P48432 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox2P48432 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox2P48432 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox2P48432 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox2P48432 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox2P48432 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox2P48432 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox2P48432 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox2P48432 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox2P48432 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox2P48432 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox2P48432 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox2P48432 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox2P48432 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox2P48432 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox2P48432 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox2P48432 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox2P48432 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox2P48432 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox2P48432 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox2P48432 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox2P48432 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox2P48432 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox2P48432 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox2P48432 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox2P48432 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox2P48432 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox2P48432 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox2P48432 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox2P48432 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox2P48432 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox2P48432 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox2P48432 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox2P48432 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox2P48432 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox2P48432 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox2P48432 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox2P48432 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox2P48432 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox2P48432 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox2P48432 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox2P48432 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox2P48432 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox2P48432 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox2P48432 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox2P48432 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox2P48432 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox2P48432 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox2P48432 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox2P48432 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox2P48432 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox2P48432 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox2P48432 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sox2P48432 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sox2P48432 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sox2P48432 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sox2P48432 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sox2P48432 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sox2P48432 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sox2P48432 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sox2P48432 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sox2P48432 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sox2P48432 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sox2P48432 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sox2P48432 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Sox2P48432 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sox2P48432 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sox2P48432 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sox2P48432 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox2P48432 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox2P48432 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox2P48432 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox2P48432 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox2P48432 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox2P48432 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox2P48432 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox2P48432 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox2P48432 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox2P48432 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox2P48432 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox2P48432 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox2P48432 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox2P48432 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox2P48432 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox2P48432 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox2P48432 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox2P48432 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox2P48432 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox2P48432 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox2P48432 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox2P48432 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox2P48432 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms