Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nedd4P46935 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nedd4P46935 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nedd4P46935 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Nedd4P46935 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Nedd4P46935 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Nedd4P46935 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nedd4P46935 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nedd4P46935 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nedd4P46935 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nedd4P46935 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nedd4P46935 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nedd4P46935 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nedd4P46935 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Nedd4P46935 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nedd4P46935 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nedd4P46935 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nedd4P46935 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nedd4P46935 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nedd4P46935 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nedd4P46935 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nedd4P46935 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nedd4P46935 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nedd4P46935 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nedd4P46935 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nedd4P46935 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nedd4P46935 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nedd4P46935 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nedd4P46935 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nedd4P46935 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nedd4P46935 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nedd4P46935 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Nedd4P46935 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nedd4P46935 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nedd4P46935 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nedd4P46935 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nedd4P46935 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nedd4P46935 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nedd4P46935 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nedd4P46935 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nedd4P46935 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nedd4P46935 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nedd4P46935 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nedd4P46935 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nedd4P46935 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nedd4P46935 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nedd4P46935 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nedd4P46935 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nedd4P46935 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nedd4P46935 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nedd4P46935 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nedd4P46935 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nedd4P46935 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nedd4P46935 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nedd4P46935 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nedd4P46935 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nedd4P46935 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nedd4P46935 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nedd4P46935 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nedd4P46935 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nedd4P46935 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nedd4P46935 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nedd4P46935 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Nedd4P46935 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nedd4P46935 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nedd4P46935 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nedd4P46935 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nedd4P46935 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nedd4P46935 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Nedd4P46935 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nedd4P46935 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nedd4P46935 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Nedd4P46935 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Nedd4P46935 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nedd4P46935 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Nedd4P46935 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Nedd4P46935 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Nedd4P46935 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nedd4P46935 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nedd4P46935 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nedd4P46935 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nedd4P46935 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nedd4P46935 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nedd4P46935 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nedd4P46935 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nedd4P46935 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nedd4P46935 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nedd4P46935 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Nedd4P46935 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nedd4P46935 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Nedd4P46935 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nedd4P46935 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nedd4P46935 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nedd4P46935 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nedd4P46935 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nedd4P46935 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nedd4P46935 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nedd4P46935 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nedd4P46935 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nedd4P46935 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.9 ms