Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TfamP40630 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TfamP40630 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TfamP40630 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TfamP40630 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TfamP40630 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TfamP40630 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TfamP40630 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TfamP40630 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TfamP40630 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TfamP40630 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TfamP40630 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TfamP40630 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TfamP40630 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TfamP40630 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TfamP40630 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TfamP40630 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TfamP40630 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TfamP40630 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TfamP40630 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TfamP40630 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TfamP40630 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TfamP40630 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TfamP40630 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TfamP40630 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TfamP40630 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TfamP40630 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TfamP40630 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TfamP40630 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TfamP40630 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TfamP40630 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TfamP40630 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TfamP40630 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TfamP40630 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TfamP40630 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TfamP40630 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TfamP40630 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TfamP40630 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TfamP40630 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TfamP40630 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TfamP40630 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TfamP40630 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TfamP40630 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TfamP40630 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TfamP40630 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TfamP40630 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TfamP40630 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TfamP40630 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TfamP40630 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TfamP40630 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TfamP40630 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TfamP40630 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TfamP40630 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TfamP40630 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TfamP40630 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TfamP40630 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TfamP40630 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TfamP40630 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TfamP40630 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TfamP40630 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TfamP40630 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TfamP40630 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TfamP40630 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TfamP40630 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TfamP40630 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TfamP40630 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TfamP40630 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TfamP40630 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TfamP40630 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TfamP40630 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TfamP40630 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TfamP40630 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TfamP40630 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TfamP40630 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TfamP40630 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TfamP40630 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TfamP40630 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TfamP40630 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TfamP40630 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TfamP40630 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TfamP40630 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TfamP40630 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TfamP40630 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TfamP40630 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TfamP40630 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TfamP40630 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TfamP40630 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TfamP40630 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TfamP40630 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TfamP40630 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TfamP40630 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TfamP40630 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TfamP40630 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TfamP40630 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TfamP40630 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TfamP40630 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TfamP40630 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TfamP40630 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TfamP40630 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TfamP40630 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.9 ms