Protein–RNA interactions for Protein: P28571

Slc6a9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a9P28571 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc6a9P28571 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc6a9P28571 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc6a9P28571 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc6a9P28571 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc6a9P28571 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc6a9P28571 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc6a9P28571 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc6a9P28571 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc6a9P28571 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc6a9P28571 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc6a9P28571 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc6a9P28571 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc6a9P28571 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc6a9P28571 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc6a9P28571 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc6a9P28571 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc6a9P28571 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc6a9P28571 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc6a9P28571 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc6a9P28571 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc6a9P28571 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc6a9P28571 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc6a9P28571 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc6a9P28571 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc6a9P28571 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc6a9P28571 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc6a9P28571 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc6a9P28571 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc6a9P28571 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc6a9P28571 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc6a9P28571 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc6a9P28571 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc6a9P28571 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc6a9P28571 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc6a9P28571 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc6a9P28571 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc6a9P28571 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc6a9P28571 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc6a9P28571 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc6a9P28571 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc6a9P28571 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc6a9P28571 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc6a9P28571 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc6a9P28571 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc6a9P28571 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slc6a9P28571 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slc6a9P28571 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slc6a9P28571 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slc6a9P28571 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc6a9P28571 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc6a9P28571 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc6a9P28571 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc6a9P28571 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc6a9P28571 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc6a9P28571 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc6a9P28571 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc6a9P28571 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc6a9P28571 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc6a9P28571 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc6a9P28571 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc6a9P28571 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc6a9P28571 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc6a9P28571 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc6a9P28571 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc6a9P28571 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc6a9P28571 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc6a9P28571 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc6a9P28571 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc6a9P28571 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc6a9P28571 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc6a9P28571 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc6a9P28571 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc6a9P28571 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc6a9P28571 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc6a9P28571 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc6a9P28571 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc6a9P28571 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc6a9P28571 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc6a9P28571 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc6a9P28571 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc6a9P28571 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc6a9P28571 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc6a9P28571 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc6a9P28571 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc6a9P28571 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc6a9P28571 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc6a9P28571 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc6a9P28571 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc6a9P28571 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc6a9P28571 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc6a9P28571 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc6a9P28571 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc6a9P28571 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc6a9P28571 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc6a9P28571 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc6a9P28571 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc6a9P28571 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc6a9P28571 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc6a9P28571 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms