Protein–RNA interactions for Protein: P18826

Phka1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phka1P18826 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Phka1P18826 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Phka1P18826 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Phka1P18826 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Phka1P18826 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Phka1P18826 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Phka1P18826 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Phka1P18826 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Phka1P18826 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phka1P18826 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phka1P18826 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Phka1P18826 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Phka1P18826 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phka1P18826 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phka1P18826 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phka1P18826 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phka1P18826 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phka1P18826 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phka1P18826 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phka1P18826 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phka1P18826 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phka1P18826 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phka1P18826 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Phka1P18826 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phka1P18826 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phka1P18826 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Phka1P18826 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Phka1P18826 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Phka1P18826 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Phka1P18826 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Phka1P18826 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Phka1P18826 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Phka1P18826 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Phka1P18826 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Phka1P18826 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Phka1P18826 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Phka1P18826 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phka1P18826 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phka1P18826 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phka1P18826 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Phka1P18826 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phka1P18826 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Phka1P18826 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phka1P18826 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phka1P18826 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phka1P18826 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phka1P18826 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phka1P18826 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phka1P18826 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Phka1P18826 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Phka1P18826 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Phka1P18826 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Phka1P18826 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Phka1P18826 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Phka1P18826 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Phka1P18826 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Phka1P18826 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Phka1P18826 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phka1P18826 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phka1P18826 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phka1P18826 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phka1P18826 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phka1P18826 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phka1P18826 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phka1P18826 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phka1P18826 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phka1P18826 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phka1P18826 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phka1P18826 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phka1P18826 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phka1P18826 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phka1P18826 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phka1P18826 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phka1P18826 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phka1P18826 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phka1P18826 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phka1P18826 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phka1P18826 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phka1P18826 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phka1P18826 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phka1P18826 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phka1P18826 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phka1P18826 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phka1P18826 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phka1P18826 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phka1P18826 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phka1P18826 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phka1P18826 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phka1P18826 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Phka1P18826 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phka1P18826 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phka1P18826 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phka1P18826 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phka1P18826 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phka1P18826 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Phka1P18826 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Phka1P18826 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Phka1P18826 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Phka1P18826 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Phka1P18826 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms