Protein–RNA interactions for Protein: P18525

Ig heavy chain V region 5-84, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18525 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P18525 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P18525 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P18525 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P18525 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P18525 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P18525 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P18525 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P18525 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P18525 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P18525 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P18525 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P18525 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P18525 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P18525 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P18525 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P18525 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P18525 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
P18525 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P18525 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P18525 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P18525 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P18525 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P18525 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P18525 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P18525 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
P18525 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
P18525 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P18525 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P18525 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P18525 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P18525 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P18525 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P18525 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P18525 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P18525 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P18525 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P18525 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P18525 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P18525 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P18525 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P18525 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P18525 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P18525 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P18525 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P18525 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P18525 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
P18525 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P18525 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P18525 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P18525 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
P18525 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P18525 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P18525 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P18525 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P18525 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P18525 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P18525 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P18525 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P18525 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P18525 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
P18525 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P18525 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P18525 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P18525 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P18525 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P18525 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P18525 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P18525 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P18525 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P18525 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P18525 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P18525 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
P18525 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P18525 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
P18525 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P18525 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P18525 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P18525 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P18525 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P18525 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P18525 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P18525 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P18525 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
P18525 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P18525 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P18525 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P18525 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P18525 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
P18525 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
P18525 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P18525 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
P18525 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P18525 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P18525 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
P18525 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
P18525 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P18525 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
P18525 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P18525 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms