Protein–RNA interactions for Protein: P0DMR5

Tdpoz1, TD and POZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdpoz1P0DMR5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tdpoz1P0DMR5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tdpoz1P0DMR5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tdpoz1P0DMR5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tdpoz1P0DMR5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tdpoz1P0DMR5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tdpoz1P0DMR5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tdpoz1P0DMR5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tdpoz1P0DMR5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tdpoz1P0DMR5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tdpoz1P0DMR5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tdpoz1P0DMR5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tdpoz1P0DMR5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tdpoz1P0DMR5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tdpoz1P0DMR5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tdpoz1P0DMR5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tdpoz1P0DMR5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tdpoz1P0DMR5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tdpoz1P0DMR5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tdpoz1P0DMR5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tdpoz1P0DMR5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tdpoz1P0DMR5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tdpoz1P0DMR5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tdpoz1P0DMR5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tdpoz1P0DMR5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tdpoz1P0DMR5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tdpoz1P0DMR5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tdpoz1P0DMR5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tdpoz1P0DMR5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tdpoz1P0DMR5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tdpoz1P0DMR5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tdpoz1P0DMR5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tdpoz1P0DMR5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tdpoz1P0DMR5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tdpoz1P0DMR5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tdpoz1P0DMR5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tdpoz1P0DMR5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tdpoz1P0DMR5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tdpoz1P0DMR5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tdpoz1P0DMR5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tdpoz1P0DMR5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tdpoz1P0DMR5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tdpoz1P0DMR5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tdpoz1P0DMR5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tdpoz1P0DMR5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tdpoz1P0DMR5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tdpoz1P0DMR5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tdpoz1P0DMR5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tdpoz1P0DMR5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tdpoz1P0DMR5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tdpoz1P0DMR5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tdpoz1P0DMR5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tdpoz1P0DMR5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tdpoz1P0DMR5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tdpoz1P0DMR5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tdpoz1P0DMR5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tdpoz1P0DMR5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tdpoz1P0DMR5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tdpoz1P0DMR5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tdpoz1P0DMR5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tdpoz1P0DMR5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tdpoz1P0DMR5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tdpoz1P0DMR5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tdpoz1P0DMR5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tdpoz1P0DMR5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tdpoz1P0DMR5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tdpoz1P0DMR5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tdpoz1P0DMR5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tdpoz1P0DMR5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tdpoz1P0DMR5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tdpoz1P0DMR5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tdpoz1P0DMR5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tdpoz1P0DMR5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tdpoz1P0DMR5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tdpoz1P0DMR5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tdpoz1P0DMR5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tdpoz1P0DMR5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tdpoz1P0DMR5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tdpoz1P0DMR5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tdpoz1P0DMR5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tdpoz1P0DMR5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tdpoz1P0DMR5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tdpoz1P0DMR5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tdpoz1P0DMR5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tdpoz1P0DMR5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tdpoz1P0DMR5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tdpoz1P0DMR5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tdpoz1P0DMR5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tdpoz1P0DMR5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tdpoz1P0DMR5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tdpoz1P0DMR5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tdpoz1P0DMR5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tdpoz1P0DMR5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tdpoz1P0DMR5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tdpoz1P0DMR5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tdpoz1P0DMR5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tdpoz1P0DMR5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tdpoz1P0DMR5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tdpoz1P0DMR5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tdpoz1P0DMR5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms