Protein–RNA interactions for Protein: P02468

Lamc1, Laminin subunit gamma-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1P02468 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Lamc1P02468 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Lamc1P02468 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Lamc1P02468 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Lamc1P02468 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Lamc1P02468 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Lamc1P02468 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Lamc1P02468 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Lamc1P02468 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Lamc1P02468 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Lamc1P02468 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Lamc1P02468 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Lamc1P02468 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Lamc1P02468 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Lamc1P02468 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Lamc1P02468 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Lamc1P02468 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Lamc1P02468 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Lamc1P02468 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Lamc1P02468 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Lamc1P02468 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lamc1P02468 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lamc1P02468 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lamc1P02468 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lamc1P02468 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lamc1P02468 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Lamc1P02468 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lamc1P02468 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lamc1P02468 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lamc1P02468 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lamc1P02468 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Lamc1P02468 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Lamc1P02468 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Lamc1P02468 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Lamc1P02468 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Lamc1P02468 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Lamc1P02468 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Lamc1P02468 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Lamc1P02468 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Lamc1P02468 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Lamc1P02468 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Lamc1P02468 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Lamc1P02468 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Lamc1P02468 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Lamc1P02468 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Lamc1P02468 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Lamc1P02468 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Lamc1P02468 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Lamc1P02468 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Lamc1P02468 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Lamc1P02468 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Lamc1P02468 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Lamc1P02468 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Lamc1P02468 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Lamc1P02468 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Lamc1P02468 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Lamc1P02468 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Lamc1P02468 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Lamc1P02468 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Lamc1P02468 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Lamc1P02468 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Lamc1P02468 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Lamc1P02468 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Lamc1P02468 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Lamc1P02468 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Lamc1P02468 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Lamc1P02468 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Lamc1P02468 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Lamc1P02468 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Lamc1P02468 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Lamc1P02468 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Lamc1P02468 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Lamc1P02468 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Lamc1P02468 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Lamc1P02468 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Lamc1P02468 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Lamc1P02468 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Lamc1P02468 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Lamc1P02468 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Lamc1P02468 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Lamc1P02468 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Lamc1P02468 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Lamc1P02468 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Lamc1P02468 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Lamc1P02468 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Lamc1P02468 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Lamc1P02468 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Lamc1P02468 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Lamc1P02468 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Lamc1P02468 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Lamc1P02468 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Lamc1P02468 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Lamc1P02468 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Lamc1P02468 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Lamc1P02468 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Lamc1P02468 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Lamc1P02468 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Lamc1P02468 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Lamc1P02468 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Lamc1P02468 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms