Protein–RNA interactions for Protein: O88983

Stx8, Syntaxin-8, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx8O88983 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stx8O88983 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Stx8O88983 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stx8O88983 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stx8O88983 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stx8O88983 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stx8O88983 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stx8O88983 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stx8O88983 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stx8O88983 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stx8O88983 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stx8O88983 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stx8O88983 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stx8O88983 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stx8O88983 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stx8O88983 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stx8O88983 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stx8O88983 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stx8O88983 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stx8O88983 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stx8O88983 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stx8O88983 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Stx8O88983 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stx8O88983 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stx8O88983 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stx8O88983 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stx8O88983 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stx8O88983 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stx8O88983 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stx8O88983 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stx8O88983 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stx8O88983 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stx8O88983 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Stx8O88983 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stx8O88983 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stx8O88983 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Stx8O88983 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Stx8O88983 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stx8O88983 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stx8O88983 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Stx8O88983 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stx8O88983 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stx8O88983 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stx8O88983 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stx8O88983 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Stx8O88983 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stx8O88983 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stx8O88983 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stx8O88983 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stx8O88983 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stx8O88983 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stx8O88983 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stx8O88983 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stx8O88983 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stx8O88983 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stx8O88983 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stx8O88983 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stx8O88983 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stx8O88983 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stx8O88983 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stx8O88983 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stx8O88983 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stx8O88983 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stx8O88983 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stx8O88983 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stx8O88983 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stx8O88983 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stx8O88983 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stx8O88983 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stx8O88983 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stx8O88983 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Stx8O88983 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stx8O88983 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stx8O88983 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stx8O88983 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stx8O88983 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stx8O88983 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stx8O88983 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stx8O88983 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stx8O88983 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stx8O88983 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stx8O88983 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Stx8O88983 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stx8O88983 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stx8O88983 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stx8O88983 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stx8O88983 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stx8O88983 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stx8O88983 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stx8O88983 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stx8O88983 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stx8O88983 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stx8O88983 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stx8O88983 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stx8O88983 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Stx8O88983 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Stx8O88983 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Stx8O88983 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Stx8O88983 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Stx8O88983 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms