Protein–RNA interactions for Protein: O54834

Arhgap6, Rho GTPase-activating protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap6O54834 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arhgap6O54834 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arhgap6O54834 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arhgap6O54834 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arhgap6O54834 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Arhgap6O54834 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Arhgap6O54834 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Arhgap6O54834 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Arhgap6O54834 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Arhgap6O54834 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Arhgap6O54834 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Arhgap6O54834 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Arhgap6O54834 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arhgap6O54834 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arhgap6O54834 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arhgap6O54834 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arhgap6O54834 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arhgap6O54834 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arhgap6O54834 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arhgap6O54834 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arhgap6O54834 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arhgap6O54834 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arhgap6O54834 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arhgap6O54834 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arhgap6O54834 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arhgap6O54834 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arhgap6O54834 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arhgap6O54834 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arhgap6O54834 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arhgap6O54834 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arhgap6O54834 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arhgap6O54834 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Arhgap6O54834 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arhgap6O54834 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arhgap6O54834 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arhgap6O54834 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arhgap6O54834 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arhgap6O54834 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arhgap6O54834 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arhgap6O54834 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arhgap6O54834 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arhgap6O54834 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arhgap6O54834 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arhgap6O54834 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arhgap6O54834 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arhgap6O54834 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arhgap6O54834 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arhgap6O54834 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arhgap6O54834 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arhgap6O54834 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arhgap6O54834 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arhgap6O54834 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arhgap6O54834 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Arhgap6O54834 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arhgap6O54834 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arhgap6O54834 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arhgap6O54834 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Arhgap6O54834 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Arhgap6O54834 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arhgap6O54834 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arhgap6O54834 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arhgap6O54834 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arhgap6O54834 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arhgap6O54834 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arhgap6O54834 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arhgap6O54834 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arhgap6O54834 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arhgap6O54834 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Arhgap6O54834 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arhgap6O54834 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Arhgap6O54834 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Arhgap6O54834 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arhgap6O54834 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arhgap6O54834 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arhgap6O54834 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arhgap6O54834 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arhgap6O54834 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arhgap6O54834 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arhgap6O54834 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arhgap6O54834 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arhgap6O54834 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arhgap6O54834 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arhgap6O54834 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arhgap6O54834 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arhgap6O54834 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arhgap6O54834 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arhgap6O54834 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Arhgap6O54834 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arhgap6O54834 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Arhgap6O54834 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arhgap6O54834 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arhgap6O54834 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arhgap6O54834 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arhgap6O54834 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arhgap6O54834 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arhgap6O54834 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arhgap6O54834 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arhgap6O54834 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arhgap6O54834 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arhgap6O54834 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 715.5 ms