Protein–RNA interactions for Protein: O35930

Gp1ba, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1baO35930 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gp1baO35930 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gp1baO35930 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gp1baO35930 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gp1baO35930 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gp1baO35930 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gp1baO35930 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gp1baO35930 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gp1baO35930 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gp1baO35930 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gp1baO35930 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gp1baO35930 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gp1baO35930 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gp1baO35930 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gp1baO35930 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gp1baO35930 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gp1baO35930 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gp1baO35930 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gp1baO35930 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Gp1baO35930 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gp1baO35930 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gp1baO35930 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gp1baO35930 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gp1baO35930 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gp1baO35930 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gp1baO35930 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gp1baO35930 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Gp1baO35930 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gp1baO35930 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Gp1baO35930 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Gp1baO35930 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gp1baO35930 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gp1baO35930 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gp1baO35930 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gp1baO35930 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gp1baO35930 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gp1baO35930 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gp1baO35930 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gp1baO35930 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gp1baO35930 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gp1baO35930 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Gp1baO35930 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gp1baO35930 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gp1baO35930 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gp1baO35930 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gp1baO35930 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gp1baO35930 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gp1baO35930 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gp1baO35930 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gp1baO35930 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gp1baO35930 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gp1baO35930 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Gp1baO35930 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gp1baO35930 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gp1baO35930 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gp1baO35930 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gp1baO35930 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gp1baO35930 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gp1baO35930 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gp1baO35930 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gp1baO35930 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gp1baO35930 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gp1baO35930 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gp1baO35930 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gp1baO35930 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gp1baO35930 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gp1baO35930 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gp1baO35930 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gp1baO35930 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gp1baO35930 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gp1baO35930 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gp1baO35930 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gp1baO35930 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gp1baO35930 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gp1baO35930 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gp1baO35930 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gp1baO35930 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gp1baO35930 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gp1baO35930 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gp1baO35930 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gp1baO35930 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gp1baO35930 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gp1baO35930 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gp1baO35930 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gp1baO35930 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gp1baO35930 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gp1baO35930 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gp1baO35930 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gp1baO35930 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gp1baO35930 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gp1baO35930 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gp1baO35930 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gp1baO35930 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gp1baO35930 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gp1baO35930 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Gp1baO35930 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gp1baO35930 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gp1baO35930 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gp1baO35930 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gp1baO35930 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms