Protein–RNA interactions for Protein: O08786

Cckar, Cholecystokinin receptor type A, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckarO08786 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CckarO08786 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CckarO08786 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CckarO08786 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CckarO08786 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CckarO08786 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CckarO08786 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CckarO08786 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CckarO08786 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CckarO08786 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CckarO08786 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CckarO08786 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CckarO08786 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CckarO08786 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CckarO08786 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CckarO08786 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CckarO08786 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CckarO08786 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CckarO08786 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CckarO08786 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CckarO08786 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CckarO08786 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CckarO08786 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CckarO08786 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CckarO08786 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CckarO08786 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CckarO08786 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CckarO08786 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CckarO08786 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CckarO08786 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CckarO08786 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CckarO08786 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CckarO08786 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CckarO08786 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CckarO08786 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CckarO08786 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CckarO08786 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CckarO08786 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CckarO08786 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CckarO08786 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CckarO08786 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CckarO08786 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CckarO08786 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CckarO08786 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CckarO08786 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CckarO08786 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CckarO08786 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CckarO08786 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CckarO08786 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CckarO08786 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CckarO08786 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CckarO08786 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CckarO08786 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CckarO08786 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CckarO08786 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CckarO08786 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CckarO08786 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CckarO08786 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CckarO08786 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CckarO08786 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CckarO08786 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CckarO08786 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CckarO08786 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CckarO08786 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CckarO08786 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CckarO08786 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CckarO08786 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CckarO08786 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CckarO08786 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CckarO08786 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CckarO08786 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CckarO08786 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CckarO08786 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CckarO08786 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CckarO08786 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CckarO08786 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CckarO08786 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CckarO08786 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CckarO08786 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CckarO08786 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CckarO08786 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CckarO08786 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CckarO08786 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CckarO08786 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CckarO08786 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CckarO08786 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CckarO08786 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CckarO08786 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CckarO08786 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CckarO08786 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CckarO08786 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CckarO08786 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CckarO08786 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CckarO08786 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CckarO08786 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CckarO08786 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CckarO08786 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CckarO08786 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CckarO08786 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CckarO08786 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 996.9 ms