Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Efna3O08545 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Efna3O08545 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Efna3O08545 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Efna3O08545 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Efna3O08545 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Efna3O08545 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Efna3O08545 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Efna3O08545 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Efna3O08545 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Efna3O08545 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Efna3O08545 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Efna3O08545 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Efna3O08545 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Efna3O08545 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Efna3O08545 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Efna3O08545 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Efna3O08545 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Efna3O08545 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Efna3O08545 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Efna3O08545 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Efna3O08545 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Efna3O08545 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Efna3O08545 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Efna3O08545 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Efna3O08545 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Efna3O08545 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Efna3O08545 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Efna3O08545 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Efna3O08545 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Efna3O08545 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efna3O08545 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efna3O08545 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Efna3O08545 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efna3O08545 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efna3O08545 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efna3O08545 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efna3O08545 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efna3O08545 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efna3O08545 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efna3O08545 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efna3O08545 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efna3O08545 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efna3O08545 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efna3O08545 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efna3O08545 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efna3O08545 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efna3O08545 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efna3O08545 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efna3O08545 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efna3O08545 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efna3O08545 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efna3O08545 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efna3O08545 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efna3O08545 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efna3O08545 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efna3O08545 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efna3O08545 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efna3O08545 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efna3O08545 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Efna3O08545 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efna3O08545 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efna3O08545 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efna3O08545 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efna3O08545 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efna3O08545 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efna3O08545 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efna3O08545 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Efna3O08545 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Efna3O08545 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Efna3O08545 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Efna3O08545 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Efna3O08545 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Efna3O08545 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Efna3O08545 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Efna3O08545 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Efna3O08545 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Efna3O08545 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Efna3O08545 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Efna3O08545 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Efna3O08545 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Efna3O08545 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Efna3O08545 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Efna3O08545 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efna3O08545 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efna3O08545 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efna3O08545 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efna3O08545 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efna3O08545 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efna3O08545 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Efna3O08545 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efna3O08545 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efna3O08545 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efna3O08545 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efna3O08545 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efna3O08545 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efna3O08545 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Efna3O08545 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Efna3O08545 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Efna3O08545 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms