Protein–RNA interactions for Protein: L7MTU6

Ifnab, Interferon alpha B, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnabL7MTU6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IfnabL7MTU6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IfnabL7MTU6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IfnabL7MTU6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IfnabL7MTU6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IfnabL7MTU6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IfnabL7MTU6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17■□□□□ 0.31
IfnabL7MTU6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IfnabL7MTU6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IfnabL7MTU6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IfnabL7MTU6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
IfnabL7MTU6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IfnabL7MTU6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IfnabL7MTU6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IfnabL7MTU6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IfnabL7MTU6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IfnabL7MTU6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IfnabL7MTU6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IfnabL7MTU6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IfnabL7MTU6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IfnabL7MTU6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IfnabL7MTU6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IfnabL7MTU6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IfnabL7MTU6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IfnabL7MTU6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IfnabL7MTU6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IfnabL7MTU6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IfnabL7MTU6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IfnabL7MTU6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IfnabL7MTU6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IfnabL7MTU6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IfnabL7MTU6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IfnabL7MTU6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IfnabL7MTU6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IfnabL7MTU6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IfnabL7MTU6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IfnabL7MTU6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IfnabL7MTU6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IfnabL7MTU6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IfnabL7MTU6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IfnabL7MTU6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IfnabL7MTU6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IfnabL7MTU6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IfnabL7MTU6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IfnabL7MTU6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IfnabL7MTU6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IfnabL7MTU6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
IfnabL7MTU6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
IfnabL7MTU6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
IfnabL7MTU6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IfnabL7MTU6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IfnabL7MTU6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
IfnabL7MTU6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IfnabL7MTU6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IfnabL7MTU6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IfnabL7MTU6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IfnabL7MTU6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IfnabL7MTU6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IfnabL7MTU6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IfnabL7MTU6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IfnabL7MTU6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
IfnabL7MTU6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IfnabL7MTU6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IfnabL7MTU6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IfnabL7MTU6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IfnabL7MTU6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IfnabL7MTU6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IfnabL7MTU6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IfnabL7MTU6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IfnabL7MTU6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IfnabL7MTU6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IfnabL7MTU6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IfnabL7MTU6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IfnabL7MTU6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IfnabL7MTU6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IfnabL7MTU6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IfnabL7MTU6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IfnabL7MTU6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IfnabL7MTU6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IfnabL7MTU6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IfnabL7MTU6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IfnabL7MTU6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IfnabL7MTU6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IfnabL7MTU6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IfnabL7MTU6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IfnabL7MTU6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IfnabL7MTU6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IfnabL7MTU6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IfnabL7MTU6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IfnabL7MTU6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IfnabL7MTU6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IfnabL7MTU6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IfnabL7MTU6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IfnabL7MTU6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IfnabL7MTU6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IfnabL7MTU6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IfnabL7MTU6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IfnabL7MTU6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IfnabL7MTU6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IfnabL7MTU6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms