Protein–RNA interactions for Protein: J3QNS5

Mfsd4b4, Major facilitator superfamily domain-containing 4B4, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4b4J3QNS5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mfsd4b4J3QNS5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Mfsd4b4J3QNS5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Mfsd4b4J3QNS5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Mfsd4b4J3QNS5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Mfsd4b4J3QNS5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mfsd4b4J3QNS5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mfsd4b4J3QNS5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mfsd4b4J3QNS5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Mfsd4b4J3QNS5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mfsd4b4J3QNS5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mfsd4b4J3QNS5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mfsd4b4J3QNS5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mfsd4b4J3QNS5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mfsd4b4J3QNS5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mfsd4b4J3QNS5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mfsd4b4J3QNS5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mfsd4b4J3QNS5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms