Protein–RNA interactions for Protein: J3QME6

Lipo1, Lipase, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lipo1J3QME6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lipo1J3QME6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lipo1J3QME6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lipo1J3QME6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lipo1J3QME6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lipo1J3QME6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lipo1J3QME6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lipo1J3QME6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lipo1J3QME6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lipo1J3QME6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lipo1J3QME6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lipo1J3QME6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lipo1J3QME6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lipo1J3QME6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lipo1J3QME6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lipo1J3QME6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Lipo1J3QME6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lipo1J3QME6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lipo1J3QME6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lipo1J3QME6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lipo1J3QME6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lipo1J3QME6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lipo1J3QME6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lipo1J3QME6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lipo1J3QME6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lipo1J3QME6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lipo1J3QME6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Lipo1J3QME6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lipo1J3QME6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lipo1J3QME6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lipo1J3QME6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lipo1J3QME6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lipo1J3QME6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lipo1J3QME6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lipo1J3QME6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lipo1J3QME6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lipo1J3QME6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lipo1J3QME6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lipo1J3QME6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lipo1J3QME6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lipo1J3QME6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lipo1J3QME6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lipo1J3QME6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lipo1J3QME6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lipo1J3QME6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lipo1J3QME6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lipo1J3QME6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lipo1J3QME6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lipo1J3QME6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lipo1J3QME6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lipo1J3QME6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lipo1J3QME6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lipo1J3QME6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lipo1J3QME6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lipo1J3QME6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lipo1J3QME6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lipo1J3QME6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lipo1J3QME6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lipo1J3QME6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Lipo1J3QME6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lipo1J3QME6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lipo1J3QME6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lipo1J3QME6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lipo1J3QME6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lipo1J3QME6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lipo1J3QME6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lipo1J3QME6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lipo1J3QME6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lipo1J3QME6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lipo1J3QME6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Lipo1J3QME6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lipo1J3QME6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lipo1J3QME6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lipo1J3QME6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lipo1J3QME6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lipo1J3QME6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lipo1J3QME6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lipo1J3QME6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lipo1J3QME6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lipo1J3QME6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lipo1J3QME6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Lipo1J3QME6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lipo1J3QME6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lipo1J3QME6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lipo1J3QME6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lipo1J3QME6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lipo1J3QME6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Lipo1J3QME6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lipo1J3QME6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lipo1J3QME6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lipo1J3QME6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lipo1J3QME6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lipo1J3QME6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lipo1J3QME6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lipo1J3QME6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lipo1J3QME6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lipo1J3QME6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lipo1J3QME6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lipo1J3QME6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lipo1J3QME6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms