Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Pabpc4lG5E8X2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pabpc4lG5E8X2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pabpc4lG5E8X2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pabpc4lG5E8X2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pabpc4lG5E8X2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pabpc4lG5E8X2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pabpc4lG5E8X2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pabpc4lG5E8X2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pabpc4lG5E8X2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pabpc4lG5E8X2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pabpc4lG5E8X2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pabpc4lG5E8X2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pabpc4lG5E8X2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Pabpc4lG5E8X2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pabpc4lG5E8X2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pabpc4lG5E8X2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pabpc4lG5E8X2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pabpc4lG5E8X2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pabpc4lG5E8X2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pabpc4lG5E8X2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pabpc4lG5E8X2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pabpc4lG5E8X2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pabpc4lG5E8X2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pabpc4lG5E8X2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pabpc4lG5E8X2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pabpc4lG5E8X2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pabpc4lG5E8X2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pabpc4lG5E8X2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pabpc4lG5E8X2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pabpc4lG5E8X2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Pabpc4lG5E8X2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pabpc4lG5E8X2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pabpc4lG5E8X2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pabpc4lG5E8X2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pabpc4lG5E8X2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pabpc4lG5E8X2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pabpc4lG5E8X2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pabpc4lG5E8X2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pabpc4lG5E8X2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pabpc4lG5E8X2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pabpc4lG5E8X2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Pabpc4lG5E8X2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pabpc4lG5E8X2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pabpc4lG5E8X2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pabpc4lG5E8X2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pabpc4lG5E8X2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pabpc4lG5E8X2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pabpc4lG5E8X2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pabpc4lG5E8X2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pabpc4lG5E8X2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pabpc4lG5E8X2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Pabpc4lG5E8X2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pabpc4lG5E8X2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pabpc4lG5E8X2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pabpc4lG5E8X2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pabpc4lG5E8X2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pabpc4lG5E8X2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pabpc4lG5E8X2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pabpc4lG5E8X2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pabpc4lG5E8X2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pabpc4lG5E8X2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pabpc4lG5E8X2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pabpc4lG5E8X2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pabpc4lG5E8X2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pabpc4lG5E8X2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pabpc4lG5E8X2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pabpc4lG5E8X2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pabpc4lG5E8X2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pabpc4lG5E8X2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pabpc4lG5E8X2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pabpc4lG5E8X2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Pabpc4lG5E8X2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pabpc4lG5E8X2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pabpc4lG5E8X2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pabpc4lG5E8X2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pabpc4lG5E8X2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pabpc4lG5E8X2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pabpc4lG5E8X2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pabpc4lG5E8X2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pabpc4lG5E8X2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pabpc4lG5E8X2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pabpc4lG5E8X2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pabpc4lG5E8X2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pabpc4lG5E8X2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pabpc4lG5E8X2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pabpc4lG5E8X2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pabpc4lG5E8X2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pabpc4lG5E8X2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pabpc4lG5E8X2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pabpc4lG5E8X2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pabpc4lG5E8X2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pabpc4lG5E8X2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pabpc4lG5E8X2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pabpc4lG5E8X2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pabpc4lG5E8X2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pabpc4lG5E8X2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pabpc4lG5E8X2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pabpc4lG5E8X2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pabpc4lG5E8X2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms