Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3Y9

2610001J05Rik, RIKEN cDNA 2610001J05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
2610001J05RikF2Z3Y9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
2610001J05RikF2Z3Y9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
2610001J05RikF2Z3Y9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
2610001J05RikF2Z3Y9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
2610001J05RikF2Z3Y9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
2610001J05RikF2Z3Y9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
2610001J05RikF2Z3Y9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
2610001J05RikF2Z3Y9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
2610001J05RikF2Z3Y9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
2610001J05RikF2Z3Y9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
2610001J05RikF2Z3Y9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
2610001J05RikF2Z3Y9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
2610001J05RikF2Z3Y9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
2610001J05RikF2Z3Y9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
2610001J05RikF2Z3Y9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
2610001J05RikF2Z3Y9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
2610001J05RikF2Z3Y9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
2610001J05RikF2Z3Y9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
2610001J05RikF2Z3Y9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
2610001J05RikF2Z3Y9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
2610001J05RikF2Z3Y9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
2610001J05RikF2Z3Y9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
2610001J05RikF2Z3Y9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
2610001J05RikF2Z3Y9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
2610001J05RikF2Z3Y9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
2610001J05RikF2Z3Y9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
2610001J05RikF2Z3Y9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
2610001J05RikF2Z3Y9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
2610001J05RikF2Z3Y9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
2610001J05RikF2Z3Y9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
2610001J05RikF2Z3Y9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
2610001J05RikF2Z3Y9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
2610001J05RikF2Z3Y9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
2610001J05RikF2Z3Y9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
2610001J05RikF2Z3Y9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
2610001J05RikF2Z3Y9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
2610001J05RikF2Z3Y9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
2610001J05RikF2Z3Y9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
2610001J05RikF2Z3Y9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
2610001J05RikF2Z3Y9 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
2610001J05RikF2Z3Y9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
2610001J05RikF2Z3Y9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
2610001J05RikF2Z3Y9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
2610001J05RikF2Z3Y9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
2610001J05RikF2Z3Y9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
2610001J05RikF2Z3Y9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
2610001J05RikF2Z3Y9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
2610001J05RikF2Z3Y9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
2610001J05RikF2Z3Y9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
2610001J05RikF2Z3Y9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
2610001J05RikF2Z3Y9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
2610001J05RikF2Z3Y9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
2610001J05RikF2Z3Y9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
2610001J05RikF2Z3Y9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
2610001J05RikF2Z3Y9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
2610001J05RikF2Z3Y9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
2610001J05RikF2Z3Y9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
2610001J05RikF2Z3Y9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
2610001J05RikF2Z3Y9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
2610001J05RikF2Z3Y9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
2610001J05RikF2Z3Y9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
2610001J05RikF2Z3Y9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
2610001J05RikF2Z3Y9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
2610001J05RikF2Z3Y9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
2610001J05RikF2Z3Y9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
2610001J05RikF2Z3Y9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
2610001J05RikF2Z3Y9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
2610001J05RikF2Z3Y9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
2610001J05RikF2Z3Y9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
2610001J05RikF2Z3Y9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
2610001J05RikF2Z3Y9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
2610001J05RikF2Z3Y9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
2610001J05RikF2Z3Y9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
2610001J05RikF2Z3Y9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
2610001J05RikF2Z3Y9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
2610001J05RikF2Z3Y9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
2610001J05RikF2Z3Y9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
2610001J05RikF2Z3Y9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
2610001J05RikF2Z3Y9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
2610001J05RikF2Z3Y9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
2610001J05RikF2Z3Y9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
2610001J05RikF2Z3Y9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
2610001J05RikF2Z3Y9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
2610001J05RikF2Z3Y9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
2610001J05RikF2Z3Y9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
2610001J05RikF2Z3Y9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms