Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8F9

6030445D17Rik, RIKEN cDNA 6030445D17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030445D17RikE9Q8F9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
6030445D17RikE9Q8F9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
6030445D17RikE9Q8F9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
6030445D17RikE9Q8F9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
6030445D17RikE9Q8F9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
6030445D17RikE9Q8F9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
6030445D17RikE9Q8F9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
6030445D17RikE9Q8F9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
6030445D17RikE9Q8F9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
6030445D17RikE9Q8F9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
6030445D17RikE9Q8F9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
6030445D17RikE9Q8F9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
6030445D17RikE9Q8F9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
6030445D17RikE9Q8F9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
6030445D17RikE9Q8F9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
6030445D17RikE9Q8F9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
6030445D17RikE9Q8F9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
6030445D17RikE9Q8F9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
6030445D17RikE9Q8F9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
6030445D17RikE9Q8F9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
6030445D17RikE9Q8F9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
6030445D17RikE9Q8F9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
6030445D17RikE9Q8F9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
6030445D17RikE9Q8F9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
6030445D17RikE9Q8F9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
6030445D17RikE9Q8F9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
6030445D17RikE9Q8F9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
6030445D17RikE9Q8F9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
6030445D17RikE9Q8F9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
6030445D17RikE9Q8F9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
6030445D17RikE9Q8F9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
6030445D17RikE9Q8F9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
6030445D17RikE9Q8F9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
6030445D17RikE9Q8F9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
6030445D17RikE9Q8F9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
6030445D17RikE9Q8F9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
6030445D17RikE9Q8F9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
6030445D17RikE9Q8F9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
6030445D17RikE9Q8F9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
6030445D17RikE9Q8F9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
6030445D17RikE9Q8F9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
6030445D17RikE9Q8F9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
6030445D17RikE9Q8F9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
6030445D17RikE9Q8F9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
6030445D17RikE9Q8F9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
6030445D17RikE9Q8F9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
6030445D17RikE9Q8F9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
6030445D17RikE9Q8F9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
6030445D17RikE9Q8F9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
6030445D17RikE9Q8F9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
6030445D17RikE9Q8F9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
6030445D17RikE9Q8F9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
6030445D17RikE9Q8F9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
6030445D17RikE9Q8F9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
6030445D17RikE9Q8F9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
6030445D17RikE9Q8F9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
6030445D17RikE9Q8F9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
6030445D17RikE9Q8F9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
6030445D17RikE9Q8F9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
6030445D17RikE9Q8F9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
6030445D17RikE9Q8F9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
6030445D17RikE9Q8F9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
6030445D17RikE9Q8F9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
6030445D17RikE9Q8F9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
6030445D17RikE9Q8F9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
6030445D17RikE9Q8F9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
6030445D17RikE9Q8F9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
6030445D17RikE9Q8F9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
6030445D17RikE9Q8F9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
6030445D17RikE9Q8F9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
6030445D17RikE9Q8F9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
6030445D17RikE9Q8F9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
6030445D17RikE9Q8F9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
6030445D17RikE9Q8F9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
6030445D17RikE9Q8F9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
6030445D17RikE9Q8F9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
6030445D17RikE9Q8F9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
6030445D17RikE9Q8F9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
6030445D17RikE9Q8F9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
6030445D17RikE9Q8F9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
6030445D17RikE9Q8F9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
6030445D17RikE9Q8F9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
6030445D17RikE9Q8F9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
6030445D17RikE9Q8F9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
6030445D17RikE9Q8F9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
6030445D17RikE9Q8F9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
6030445D17RikE9Q8F9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
6030445D17RikE9Q8F9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
6030445D17RikE9Q8F9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
6030445D17RikE9Q8F9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
6030445D17RikE9Q8F9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
6030445D17RikE9Q8F9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
6030445D17RikE9Q8F9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
6030445D17RikE9Q8F9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
6030445D17RikE9Q8F9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
6030445D17RikE9Q8F9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
6030445D17RikE9Q8F9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
6030445D17RikE9Q8F9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
6030445D17RikE9Q8F9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
6030445D17RikE9Q8F9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms