Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E5

Srsf11, Serine/arginine-rich-splicing factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf11E9Q6E5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Srsf11E9Q6E5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Srsf11E9Q6E5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Srsf11E9Q6E5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Srsf11E9Q6E5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Srsf11E9Q6E5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Srsf11E9Q6E5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Srsf11E9Q6E5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Srsf11E9Q6E5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Srsf11E9Q6E5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Srsf11E9Q6E5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Srsf11E9Q6E5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Srsf11E9Q6E5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Srsf11E9Q6E5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Srsf11E9Q6E5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Srsf11E9Q6E5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Srsf11E9Q6E5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Srsf11E9Q6E5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Srsf11E9Q6E5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Srsf11E9Q6E5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Srsf11E9Q6E5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Srsf11E9Q6E5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Srsf11E9Q6E5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Srsf11E9Q6E5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Srsf11E9Q6E5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Srsf11E9Q6E5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Srsf11E9Q6E5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Srsf11E9Q6E5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Srsf11E9Q6E5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Srsf11E9Q6E5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Srsf11E9Q6E5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Srsf11E9Q6E5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Srsf11E9Q6E5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Srsf11E9Q6E5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Srsf11E9Q6E5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Srsf11E9Q6E5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Srsf11E9Q6E5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Srsf11E9Q6E5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Srsf11E9Q6E5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Srsf11E9Q6E5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Srsf11E9Q6E5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Srsf11E9Q6E5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Srsf11E9Q6E5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Srsf11E9Q6E5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Srsf11E9Q6E5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Srsf11E9Q6E5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Srsf11E9Q6E5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Srsf11E9Q6E5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Srsf11E9Q6E5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Srsf11E9Q6E5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Srsf11E9Q6E5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Srsf11E9Q6E5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Srsf11E9Q6E5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Srsf11E9Q6E5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Srsf11E9Q6E5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Srsf11E9Q6E5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Srsf11E9Q6E5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Srsf11E9Q6E5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Srsf11E9Q6E5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Srsf11E9Q6E5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Srsf11E9Q6E5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Srsf11E9Q6E5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Srsf11E9Q6E5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Srsf11E9Q6E5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Srsf11E9Q6E5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Srsf11E9Q6E5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Srsf11E9Q6E5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Srsf11E9Q6E5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Srsf11E9Q6E5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Srsf11E9Q6E5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Srsf11E9Q6E5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Srsf11E9Q6E5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Srsf11E9Q6E5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Srsf11E9Q6E5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Srsf11E9Q6E5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Srsf11E9Q6E5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Srsf11E9Q6E5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Srsf11E9Q6E5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Srsf11E9Q6E5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Srsf11E9Q6E5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Srsf11E9Q6E5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Srsf11E9Q6E5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Srsf11E9Q6E5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Srsf11E9Q6E5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Srsf11E9Q6E5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Srsf11E9Q6E5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Srsf11E9Q6E5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Srsf11E9Q6E5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Srsf11E9Q6E5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Srsf11E9Q6E5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Srsf11E9Q6E5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Srsf11E9Q6E5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Srsf11E9Q6E5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Srsf11E9Q6E5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Srsf11E9Q6E5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Srsf11E9Q6E5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Srsf11E9Q6E5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Srsf11E9Q6E5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Srsf11E9Q6E5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Srsf11E9Q6E5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms