Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5T1

Ccdc78, Coiled-coil domain-containing protein 78, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc78D3Z5T1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc78D3Z5T1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc78D3Z5T1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc78D3Z5T1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc78D3Z5T1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc78D3Z5T1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc78D3Z5T1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc78D3Z5T1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc78D3Z5T1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc78D3Z5T1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc78D3Z5T1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc78D3Z5T1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc78D3Z5T1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc78D3Z5T1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc78D3Z5T1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc78D3Z5T1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc78D3Z5T1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc78D3Z5T1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc78D3Z5T1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc78D3Z5T1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc78D3Z5T1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc78D3Z5T1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc78D3Z5T1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc78D3Z5T1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc78D3Z5T1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc78D3Z5T1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc78D3Z5T1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc78D3Z5T1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc78D3Z5T1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc78D3Z5T1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc78D3Z5T1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc78D3Z5T1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc78D3Z5T1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc78D3Z5T1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc78D3Z5T1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc78D3Z5T1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc78D3Z5T1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc78D3Z5T1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc78D3Z5T1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc78D3Z5T1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc78D3Z5T1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc78D3Z5T1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc78D3Z5T1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc78D3Z5T1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc78D3Z5T1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc78D3Z5T1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc78D3Z5T1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc78D3Z5T1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc78D3Z5T1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc78D3Z5T1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc78D3Z5T1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc78D3Z5T1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc78D3Z5T1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc78D3Z5T1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc78D3Z5T1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc78D3Z5T1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc78D3Z5T1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc78D3Z5T1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc78D3Z5T1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc78D3Z5T1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc78D3Z5T1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc78D3Z5T1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc78D3Z5T1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc78D3Z5T1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc78D3Z5T1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc78D3Z5T1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc78D3Z5T1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc78D3Z5T1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc78D3Z5T1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc78D3Z5T1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc78D3Z5T1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc78D3Z5T1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc78D3Z5T1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc78D3Z5T1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc78D3Z5T1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc78D3Z5T1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc78D3Z5T1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc78D3Z5T1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc78D3Z5T1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc78D3Z5T1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc78D3Z5T1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc78D3Z5T1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc78D3Z5T1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc78D3Z5T1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc78D3Z5T1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc78D3Z5T1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc78D3Z5T1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc78D3Z5T1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc78D3Z5T1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc78D3Z5T1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc78D3Z5T1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc78D3Z5T1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc78D3Z5T1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc78D3Z5T1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc78D3Z5T1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc78D3Z5T1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc78D3Z5T1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc78D3Z5T1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc78D3Z5T1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc78D3Z5T1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.6 ms