Protein–RNA interactions for Protein: A3KG59

Pm20d2, Peptidase M20 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pm20d2A3KG59 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pm20d2A3KG59 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pm20d2A3KG59 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pm20d2A3KG59 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Pm20d2A3KG59 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pm20d2A3KG59 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pm20d2A3KG59 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pm20d2A3KG59 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pm20d2A3KG59 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pm20d2A3KG59 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pm20d2A3KG59 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pm20d2A3KG59 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pm20d2A3KG59 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pm20d2A3KG59 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pm20d2A3KG59 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pm20d2A3KG59 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pm20d2A3KG59 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pm20d2A3KG59 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pm20d2A3KG59 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pm20d2A3KG59 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pm20d2A3KG59 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pm20d2A3KG59 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pm20d2A3KG59 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pm20d2A3KG59 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pm20d2A3KG59 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pm20d2A3KG59 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pm20d2A3KG59 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pm20d2A3KG59 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Pm20d2A3KG59 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pm20d2A3KG59 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pm20d2A3KG59 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pm20d2A3KG59 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pm20d2A3KG59 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pm20d2A3KG59 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pm20d2A3KG59 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pm20d2A3KG59 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pm20d2A3KG59 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pm20d2A3KG59 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pm20d2A3KG59 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pm20d2A3KG59 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pm20d2A3KG59 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pm20d2A3KG59 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pm20d2A3KG59 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pm20d2A3KG59 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pm20d2A3KG59 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pm20d2A3KG59 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pm20d2A3KG59 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pm20d2A3KG59 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pm20d2A3KG59 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pm20d2A3KG59 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pm20d2A3KG59 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pm20d2A3KG59 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pm20d2A3KG59 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pm20d2A3KG59 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pm20d2A3KG59 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pm20d2A3KG59 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Pm20d2A3KG59 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pm20d2A3KG59 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pm20d2A3KG59 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pm20d2A3KG59 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pm20d2A3KG59 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pm20d2A3KG59 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pm20d2A3KG59 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pm20d2A3KG59 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pm20d2A3KG59 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pm20d2A3KG59 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pm20d2A3KG59 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pm20d2A3KG59 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pm20d2A3KG59 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pm20d2A3KG59 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pm20d2A3KG59 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pm20d2A3KG59 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pm20d2A3KG59 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pm20d2A3KG59 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pm20d2A3KG59 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pm20d2A3KG59 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pm20d2A3KG59 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pm20d2A3KG59 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pm20d2A3KG59 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pm20d2A3KG59 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pm20d2A3KG59 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms