Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H1

Trbv12-2, T cell receptor beta, variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trbv12-2A0A0B4J1H1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trbv12-2A0A0B4J1H1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trbv12-2A0A0B4J1H1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trbv12-2A0A0B4J1H1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trbv12-2A0A0B4J1H1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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