Protein–RNA interactions for Protein: S4R1W5

Rbm6, RNA-binding motif protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm6S4R1W5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rbm6S4R1W5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rbm6S4R1W5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rbm6S4R1W5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rbm6S4R1W5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rbm6S4R1W5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rbm6S4R1W5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rbm6S4R1W5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rbm6S4R1W5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rbm6S4R1W5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Rbm6S4R1W5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Rbm6S4R1W5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rbm6S4R1W5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rbm6S4R1W5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rbm6S4R1W5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rbm6S4R1W5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rbm6S4R1W5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rbm6S4R1W5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rbm6S4R1W5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rbm6S4R1W5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rbm6S4R1W5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rbm6S4R1W5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rbm6S4R1W5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rbm6S4R1W5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rbm6S4R1W5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rbm6S4R1W5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rbm6S4R1W5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rbm6S4R1W5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rbm6S4R1W5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rbm6S4R1W5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rbm6S4R1W5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rbm6S4R1W5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rbm6S4R1W5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rbm6S4R1W5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rbm6S4R1W5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rbm6S4R1W5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rbm6S4R1W5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rbm6S4R1W5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rbm6S4R1W5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rbm6S4R1W5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rbm6S4R1W5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rbm6S4R1W5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rbm6S4R1W5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rbm6S4R1W5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rbm6S4R1W5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rbm6S4R1W5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rbm6S4R1W5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rbm6S4R1W5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rbm6S4R1W5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rbm6S4R1W5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rbm6S4R1W5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rbm6S4R1W5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rbm6S4R1W5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rbm6S4R1W5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rbm6S4R1W5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Rbm6S4R1W5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rbm6S4R1W5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rbm6S4R1W5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Rbm6S4R1W5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Rbm6S4R1W5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Rbm6S4R1W5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rbm6S4R1W5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rbm6S4R1W5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rbm6S4R1W5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rbm6S4R1W5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rbm6S4R1W5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rbm6S4R1W5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rbm6S4R1W5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rbm6S4R1W5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rbm6S4R1W5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rbm6S4R1W5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rbm6S4R1W5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rbm6S4R1W5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rbm6S4R1W5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rbm6S4R1W5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rbm6S4R1W5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Rbm6S4R1W5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rbm6S4R1W5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rbm6S4R1W5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rbm6S4R1W5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rbm6S4R1W5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rbm6S4R1W5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rbm6S4R1W5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rbm6S4R1W5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rbm6S4R1W5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rbm6S4R1W5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rbm6S4R1W5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rbm6S4R1W5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rbm6S4R1W5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Rbm6S4R1W5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rbm6S4R1W5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rbm6S4R1W5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rbm6S4R1W5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rbm6S4R1W5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rbm6S4R1W5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rbm6S4R1W5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rbm6S4R1W5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rbm6S4R1W5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rbm6S4R1W5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rbm6S4R1W5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms