Protein–RNA interactions for Protein: S4R181

Ccdc166, Coiled-coil domain-containing 166, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc166S4R181 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc166S4R181 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc166S4R181 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc166S4R181 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc166S4R181 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc166S4R181 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc166S4R181 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc166S4R181 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc166S4R181 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc166S4R181 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc166S4R181 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc166S4R181 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc166S4R181 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc166S4R181 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc166S4R181 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc166S4R181 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc166S4R181 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc166S4R181 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc166S4R181 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc166S4R181 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc166S4R181 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc166S4R181 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc166S4R181 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc166S4R181 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc166S4R181 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc166S4R181 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc166S4R181 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc166S4R181 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc166S4R181 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc166S4R181 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc166S4R181 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc166S4R181 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc166S4R181 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc166S4R181 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc166S4R181 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc166S4R181 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc166S4R181 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc166S4R181 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc166S4R181 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc166S4R181 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc166S4R181 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc166S4R181 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc166S4R181 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc166S4R181 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc166S4R181 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc166S4R181 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc166S4R181 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc166S4R181 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc166S4R181 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc166S4R181 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc166S4R181 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc166S4R181 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc166S4R181 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc166S4R181 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc166S4R181 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc166S4R181 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc166S4R181 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc166S4R181 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc166S4R181 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc166S4R181 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc166S4R181 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc166S4R181 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc166S4R181 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc166S4R181 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc166S4R181 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc166S4R181 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc166S4R181 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc166S4R181 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc166S4R181 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc166S4R181 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc166S4R181 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc166S4R181 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc166S4R181 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc166S4R181 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc166S4R181 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc166S4R181 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc166S4R181 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc166S4R181 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc166S4R181 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc166S4R181 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc166S4R181 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc166S4R181 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc166S4R181 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc166S4R181 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc166S4R181 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc166S4R181 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc166S4R181 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc166S4R181 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc166S4R181 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc166S4R181 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc166S4R181 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc166S4R181 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc166S4R181 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc166S4R181 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc166S4R181 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc166S4R181 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc166S4R181 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc166S4R181 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc166S4R181 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc166S4R181 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms