Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2S7

Tsc22d3, TSC22 domain family protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc22d3Q9Z2S7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tsc22d3Q9Z2S7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tsc22d3Q9Z2S7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tsc22d3Q9Z2S7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tsc22d3Q9Z2S7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tsc22d3Q9Z2S7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tsc22d3Q9Z2S7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tsc22d3Q9Z2S7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tsc22d3Q9Z2S7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tsc22d3Q9Z2S7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tsc22d3Q9Z2S7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tsc22d3Q9Z2S7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tsc22d3Q9Z2S7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tsc22d3Q9Z2S7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tsc22d3Q9Z2S7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tsc22d3Q9Z2S7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tsc22d3Q9Z2S7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tsc22d3Q9Z2S7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tsc22d3Q9Z2S7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tsc22d3Q9Z2S7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tsc22d3Q9Z2S7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tsc22d3Q9Z2S7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tsc22d3Q9Z2S7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tsc22d3Q9Z2S7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tsc22d3Q9Z2S7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tsc22d3Q9Z2S7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tsc22d3Q9Z2S7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tsc22d3Q9Z2S7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tsc22d3Q9Z2S7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tsc22d3Q9Z2S7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tsc22d3Q9Z2S7 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Tsc22d3Q9Z2S7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tsc22d3Q9Z2S7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tsc22d3Q9Z2S7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tsc22d3Q9Z2S7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tsc22d3Q9Z2S7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tsc22d3Q9Z2S7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tsc22d3Q9Z2S7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tsc22d3Q9Z2S7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tsc22d3Q9Z2S7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tsc22d3Q9Z2S7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tsc22d3Q9Z2S7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tsc22d3Q9Z2S7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tsc22d3Q9Z2S7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tsc22d3Q9Z2S7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tsc22d3Q9Z2S7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tsc22d3Q9Z2S7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tsc22d3Q9Z2S7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms