Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Knop1Q9Z2Q2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Knop1Q9Z2Q2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Knop1Q9Z2Q2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Knop1Q9Z2Q2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Knop1Q9Z2Q2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Knop1Q9Z2Q2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Knop1Q9Z2Q2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Knop1Q9Z2Q2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Knop1Q9Z2Q2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Knop1Q9Z2Q2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Knop1Q9Z2Q2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Knop1Q9Z2Q2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Knop1Q9Z2Q2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Knop1Q9Z2Q2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Knop1Q9Z2Q2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Knop1Q9Z2Q2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Knop1Q9Z2Q2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Knop1Q9Z2Q2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Knop1Q9Z2Q2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Knop1Q9Z2Q2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Knop1Q9Z2Q2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Knop1Q9Z2Q2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Knop1Q9Z2Q2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Knop1Q9Z2Q2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Knop1Q9Z2Q2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Knop1Q9Z2Q2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Knop1Q9Z2Q2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Knop1Q9Z2Q2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Knop1Q9Z2Q2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Knop1Q9Z2Q2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Knop1Q9Z2Q2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Knop1Q9Z2Q2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Knop1Q9Z2Q2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Knop1Q9Z2Q2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Knop1Q9Z2Q2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Knop1Q9Z2Q2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Knop1Q9Z2Q2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Knop1Q9Z2Q2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Knop1Q9Z2Q2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Knop1Q9Z2Q2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Knop1Q9Z2Q2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Knop1Q9Z2Q2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Knop1Q9Z2Q2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Knop1Q9Z2Q2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Knop1Q9Z2Q2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Knop1Q9Z2Q2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Knop1Q9Z2Q2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Knop1Q9Z2Q2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Knop1Q9Z2Q2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Knop1Q9Z2Q2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Knop1Q9Z2Q2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Knop1Q9Z2Q2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Knop1Q9Z2Q2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Knop1Q9Z2Q2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Knop1Q9Z2Q2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Knop1Q9Z2Q2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Knop1Q9Z2Q2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Knop1Q9Z2Q2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Knop1Q9Z2Q2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Knop1Q9Z2Q2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Knop1Q9Z2Q2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Knop1Q9Z2Q2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Knop1Q9Z2Q2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Knop1Q9Z2Q2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Knop1Q9Z2Q2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Knop1Q9Z2Q2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Knop1Q9Z2Q2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Knop1Q9Z2Q2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Knop1Q9Z2Q2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Knop1Q9Z2Q2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Knop1Q9Z2Q2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Knop1Q9Z2Q2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Knop1Q9Z2Q2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Knop1Q9Z2Q2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Knop1Q9Z2Q2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Knop1Q9Z2Q2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Knop1Q9Z2Q2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Knop1Q9Z2Q2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Knop1Q9Z2Q2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Knop1Q9Z2Q2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Knop1Q9Z2Q2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Knop1Q9Z2Q2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Knop1Q9Z2Q2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Knop1Q9Z2Q2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Knop1Q9Z2Q2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Knop1Q9Z2Q2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Knop1Q9Z2Q2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Knop1Q9Z2Q2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Knop1Q9Z2Q2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Knop1Q9Z2Q2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Knop1Q9Z2Q2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Knop1Q9Z2Q2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Knop1Q9Z2Q2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Knop1Q9Z2Q2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Knop1Q9Z2Q2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Knop1Q9Z2Q2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Knop1Q9Z2Q2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Knop1Q9Z2Q2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22■■□□□ 1.11
Knop1Q9Z2Q2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms