Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ubl3Q9Z2M6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ubl3Q9Z2M6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ubl3Q9Z2M6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ubl3Q9Z2M6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ubl3Q9Z2M6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ubl3Q9Z2M6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ubl3Q9Z2M6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ubl3Q9Z2M6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ubl3Q9Z2M6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ubl3Q9Z2M6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ubl3Q9Z2M6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ubl3Q9Z2M6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ubl3Q9Z2M6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ubl3Q9Z2M6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ubl3Q9Z2M6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ubl3Q9Z2M6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ubl3Q9Z2M6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ubl3Q9Z2M6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ubl3Q9Z2M6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ubl3Q9Z2M6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ubl3Q9Z2M6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ubl3Q9Z2M6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ubl3Q9Z2M6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ubl3Q9Z2M6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ubl3Q9Z2M6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ubl3Q9Z2M6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ubl3Q9Z2M6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ubl3Q9Z2M6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubl3Q9Z2M6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubl3Q9Z2M6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubl3Q9Z2M6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubl3Q9Z2M6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubl3Q9Z2M6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubl3Q9Z2M6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubl3Q9Z2M6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubl3Q9Z2M6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubl3Q9Z2M6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubl3Q9Z2M6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubl3Q9Z2M6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubl3Q9Z2M6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubl3Q9Z2M6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubl3Q9Z2M6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubl3Q9Z2M6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubl3Q9Z2M6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubl3Q9Z2M6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubl3Q9Z2M6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubl3Q9Z2M6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubl3Q9Z2M6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubl3Q9Z2M6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubl3Q9Z2M6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubl3Q9Z2M6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubl3Q9Z2M6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubl3Q9Z2M6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubl3Q9Z2M6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubl3Q9Z2M6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubl3Q9Z2M6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ubl3Q9Z2M6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubl3Q9Z2M6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubl3Q9Z2M6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubl3Q9Z2M6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubl3Q9Z2M6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubl3Q9Z2M6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubl3Q9Z2M6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubl3Q9Z2M6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubl3Q9Z2M6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubl3Q9Z2M6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubl3Q9Z2M6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubl3Q9Z2M6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubl3Q9Z2M6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubl3Q9Z2M6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubl3Q9Z2M6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubl3Q9Z2M6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubl3Q9Z2M6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubl3Q9Z2M6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubl3Q9Z2M6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubl3Q9Z2M6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ubl3Q9Z2M6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ubl3Q9Z2M6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ubl3Q9Z2M6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ubl3Q9Z2M6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ubl3Q9Z2M6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ubl3Q9Z2M6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ubl3Q9Z2M6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ubl3Q9Z2M6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ubl3Q9Z2M6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ubl3Q9Z2M6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ubl3Q9Z2M6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ubl3Q9Z2M6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ubl3Q9Z2M6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ubl3Q9Z2M6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ubl3Q9Z2M6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ubl3Q9Z2M6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ubl3Q9Z2M6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ubl3Q9Z2M6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ubl3Q9Z2M6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubl3Q9Z2M6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubl3Q9Z2M6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubl3Q9Z2M6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms