Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W3

Nup160, Nuclear pore complex protein Nup160, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup160Q9Z0W3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Nup160Q9Z0W3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
Nup160Q9Z0W3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Nup160Q9Z0W3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
Nup160Q9Z0W3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Nup160Q9Z0W3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Nup160Q9Z0W3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Nup160Q9Z0W3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
Nup160Q9Z0W3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Nup160Q9Z0W3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Nup160Q9Z0W3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Nup160Q9Z0W3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
Nup160Q9Z0W3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
Nup160Q9Z0W3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Nup160Q9Z0W3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Nup160Q9Z0W3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Nup160Q9Z0W3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Nup160Q9Z0W3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Nup160Q9Z0W3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Nup160Q9Z0W3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Nup160Q9Z0W3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Nup160Q9Z0W3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Nup160Q9Z0W3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Nup160Q9Z0W3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Nup160Q9Z0W3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Nup160Q9Z0W3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Nup160Q9Z0W3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Nup160Q9Z0W3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Nup160Q9Z0W3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Nup160Q9Z0W3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Nup160Q9Z0W3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Nup160Q9Z0W3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Nup160Q9Z0W3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Nup160Q9Z0W3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Nup160Q9Z0W3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Nup160Q9Z0W3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Nup160Q9Z0W3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Nup160Q9Z0W3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Nup160Q9Z0W3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Nup160Q9Z0W3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
Nup160Q9Z0W3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Nup160Q9Z0W3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Nup160Q9Z0W3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Nup160Q9Z0W3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Nup160Q9Z0W3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Nup160Q9Z0W3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Nup160Q9Z0W3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Nup160Q9Z0W3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Nup160Q9Z0W3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Nup160Q9Z0W3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Nup160Q9Z0W3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
Nup160Q9Z0W3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
Nup160Q9Z0W3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
Nup160Q9Z0W3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Nup160Q9Z0W3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
Nup160Q9Z0W3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
Nup160Q9Z0W3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Nup160Q9Z0W3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
Nup160Q9Z0W3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
Nup160Q9Z0W3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Nup160Q9Z0W3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Nup160Q9Z0W3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Nup160Q9Z0W3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Nup160Q9Z0W3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Nup160Q9Z0W3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Nup160Q9Z0W3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
Nup160Q9Z0W3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Nup160Q9Z0W3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
Nup160Q9Z0W3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
Nup160Q9Z0W3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
Nup160Q9Z0W3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Nup160Q9Z0W3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Nup160Q9Z0W3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Nup160Q9Z0W3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Nup160Q9Z0W3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Nup160Q9Z0W3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Nup160Q9Z0W3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
Nup160Q9Z0W3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Nup160Q9Z0W3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Nup160Q9Z0W3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Nup160Q9Z0W3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Nup160Q9Z0W3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Nup160Q9Z0W3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Nup160Q9Z0W3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Nup160Q9Z0W3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Nup160Q9Z0W3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Nup160Q9Z0W3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Nup160Q9Z0W3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Nup160Q9Z0W3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Nup160Q9Z0W3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Nup160Q9Z0W3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
Nup160Q9Z0W3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
Nup160Q9Z0W3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Nup160Q9Z0W3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Nup160Q9Z0W3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Nup160Q9Z0W3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
Nup160Q9Z0W3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Nup160Q9Z0W3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
Nup160Q9Z0W3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Nup160Q9Z0W3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms