Protein–RNA interactions for Protein: Q9R013

Ctsf, Cathepsin F, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsfQ9R013 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CtsfQ9R013 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CtsfQ9R013 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CtsfQ9R013 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CtsfQ9R013 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CtsfQ9R013 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CtsfQ9R013 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CtsfQ9R013 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CtsfQ9R013 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CtsfQ9R013 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CtsfQ9R013 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CtsfQ9R013 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CtsfQ9R013 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CtsfQ9R013 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
CtsfQ9R013 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CtsfQ9R013 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CtsfQ9R013 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CtsfQ9R013 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CtsfQ9R013 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CtsfQ9R013 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CtsfQ9R013 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CtsfQ9R013 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CtsfQ9R013 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CtsfQ9R013 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CtsfQ9R013 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CtsfQ9R013 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CtsfQ9R013 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CtsfQ9R013 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CtsfQ9R013 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CtsfQ9R013 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CtsfQ9R013 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CtsfQ9R013 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CtsfQ9R013 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CtsfQ9R013 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CtsfQ9R013 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CtsfQ9R013 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CtsfQ9R013 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CtsfQ9R013 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CtsfQ9R013 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CtsfQ9R013 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CtsfQ9R013 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CtsfQ9R013 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CtsfQ9R013 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CtsfQ9R013 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CtsfQ9R013 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CtsfQ9R013 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CtsfQ9R013 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CtsfQ9R013 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CtsfQ9R013 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CtsfQ9R013 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CtsfQ9R013 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CtsfQ9R013 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CtsfQ9R013 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CtsfQ9R013 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CtsfQ9R013 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CtsfQ9R013 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CtsfQ9R013 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CtsfQ9R013 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CtsfQ9R013 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CtsfQ9R013 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CtsfQ9R013 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CtsfQ9R013 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CtsfQ9R013 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CtsfQ9R013 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CtsfQ9R013 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CtsfQ9R013 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CtsfQ9R013 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CtsfQ9R013 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CtsfQ9R013 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CtsfQ9R013 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CtsfQ9R013 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CtsfQ9R013 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CtsfQ9R013 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CtsfQ9R013 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CtsfQ9R013 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CtsfQ9R013 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CtsfQ9R013 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CtsfQ9R013 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CtsfQ9R013 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CtsfQ9R013 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CtsfQ9R013 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CtsfQ9R013 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CtsfQ9R013 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CtsfQ9R013 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CtsfQ9R013 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CtsfQ9R013 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CtsfQ9R013 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CtsfQ9R013 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CtsfQ9R013 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CtsfQ9R013 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CtsfQ9R013 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CtsfQ9R013 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CtsfQ9R013 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CtsfQ9R013 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CtsfQ9R013 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CtsfQ9R013 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CtsfQ9R013 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CtsfQ9R013 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CtsfQ9R013 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CtsfQ9R013 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms