Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpc1Q9QZF2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpc1Q9QZF2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpc1Q9QZF2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpc1Q9QZF2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gpc1Q9QZF2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gpc1Q9QZF2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gpc1Q9QZF2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gpc1Q9QZF2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gpc1Q9QZF2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gpc1Q9QZF2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gpc1Q9QZF2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gpc1Q9QZF2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gpc1Q9QZF2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gpc1Q9QZF2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gpc1Q9QZF2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gpc1Q9QZF2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gpc1Q9QZF2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gpc1Q9QZF2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gpc1Q9QZF2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gpc1Q9QZF2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gpc1Q9QZF2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gpc1Q9QZF2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gpc1Q9QZF2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gpc1Q9QZF2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gpc1Q9QZF2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gpc1Q9QZF2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gpc1Q9QZF2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gpc1Q9QZF2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gpc1Q9QZF2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gpc1Q9QZF2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gpc1Q9QZF2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gpc1Q9QZF2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gpc1Q9QZF2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gpc1Q9QZF2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gpc1Q9QZF2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gpc1Q9QZF2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gpc1Q9QZF2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gpc1Q9QZF2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gpc1Q9QZF2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gpc1Q9QZF2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gpc1Q9QZF2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gpc1Q9QZF2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gpc1Q9QZF2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gpc1Q9QZF2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gpc1Q9QZF2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gpc1Q9QZF2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gpc1Q9QZF2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gpc1Q9QZF2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gpc1Q9QZF2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gpc1Q9QZF2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gpc1Q9QZF2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gpc1Q9QZF2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gpc1Q9QZF2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gpc1Q9QZF2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gpc1Q9QZF2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gpc1Q9QZF2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gpc1Q9QZF2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gpc1Q9QZF2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gpc1Q9QZF2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gpc1Q9QZF2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gpc1Q9QZF2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gpc1Q9QZF2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gpc1Q9QZF2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gpc1Q9QZF2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gpc1Q9QZF2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gpc1Q9QZF2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gpc1Q9QZF2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gpc1Q9QZF2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gpc1Q9QZF2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gpc1Q9QZF2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gpc1Q9QZF2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gpc1Q9QZF2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gpc1Q9QZF2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gpc1Q9QZF2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gpc1Q9QZF2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gpc1Q9QZF2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gpc1Q9QZF2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gpc1Q9QZF2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gpc1Q9QZF2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gpc1Q9QZF2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gpc1Q9QZF2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gpc1Q9QZF2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gpc1Q9QZF2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gpc1Q9QZF2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gpc1Q9QZF2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gpc1Q9QZF2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gpc1Q9QZF2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gpc1Q9QZF2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gpc1Q9QZF2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gpc1Q9QZF2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gpc1Q9QZF2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gpc1Q9QZF2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gpc1Q9QZF2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gpc1Q9QZF2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gpc1Q9QZF2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gpc1Q9QZF2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gpc1Q9QZF2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Gpc1Q9QZF2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gpc1Q9QZF2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms