Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

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Length 836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpc3Q9QZC1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpc3Q9QZC1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpc3Q9QZC1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpc3Q9QZC1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpc3Q9QZC1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpc3Q9QZC1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpc3Q9QZC1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpc3Q9QZC1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpc3Q9QZC1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpc3Q9QZC1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpc3Q9QZC1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpc3Q9QZC1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpc3Q9QZC1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpc3Q9QZC1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpc3Q9QZC1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpc3Q9QZC1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trpc3Q9QZC1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Trpc3Q9QZC1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Trpc3Q9QZC1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trpc3Q9QZC1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trpc3Q9QZC1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Trpc3Q9QZC1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpc3Q9QZC1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpc3Q9QZC1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpc3Q9QZC1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpc3Q9QZC1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpc3Q9QZC1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpc3Q9QZC1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpc3Q9QZC1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpc3Q9QZC1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpc3Q9QZC1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpc3Q9QZC1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpc3Q9QZC1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpc3Q9QZC1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpc3Q9QZC1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpc3Q9QZC1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpc3Q9QZC1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpc3Q9QZC1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpc3Q9QZC1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpc3Q9QZC1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpc3Q9QZC1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpc3Q9QZC1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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Trpc3Q9QZC1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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Trpc3Q9QZC1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpc3Q9QZC1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpc3Q9QZC1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpc3Q9QZC1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpc3Q9QZC1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpc3Q9QZC1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpc3Q9QZC1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpc3Q9QZC1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpc3Q9QZC1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpc3Q9QZC1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpc3Q9QZC1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpc3Q9QZC1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpc3Q9QZC1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpc3Q9QZC1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpc3Q9QZC1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpc3Q9QZC1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpc3Q9QZC1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpc3Q9QZC1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpc3Q9QZC1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpc3Q9QZC1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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Trpc3Q9QZC1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpc3Q9QZC1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpc3Q9QZC1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpc3Q9QZC1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpc3Q9QZC1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpc3Q9QZC1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpc3Q9QZC1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpc3Q9QZC1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpc3Q9QZC1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpc3Q9QZC1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpc3Q9QZC1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpc3Q9QZC1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trpc3Q9QZC1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trpc3Q9QZC1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trpc3Q9QZC1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trpc3Q9QZC1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trpc3Q9QZC1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Trpc3Q9QZC1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trpc3Q9QZC1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trpc3Q9QZC1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trpc3Q9QZC1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trpc3Q9QZC1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trpc3Q9QZC1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trpc3Q9QZC1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trpc3Q9QZC1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trpc3Q9QZC1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trpc3Q9QZC1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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