Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Six6Q9QZ28 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Six6Q9QZ28 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Six6Q9QZ28 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Six6Q9QZ28 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Six6Q9QZ28 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Six6Q9QZ28 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Six6Q9QZ28 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Six6Q9QZ28 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Six6Q9QZ28 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Six6Q9QZ28 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Six6Q9QZ28 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Six6Q9QZ28 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Six6Q9QZ28 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Six6Q9QZ28 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Six6Q9QZ28 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Six6Q9QZ28 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Six6Q9QZ28 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Six6Q9QZ28 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Six6Q9QZ28 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Six6Q9QZ28 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Six6Q9QZ28 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Six6Q9QZ28 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Six6Q9QZ28 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Six6Q9QZ28 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Six6Q9QZ28 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Six6Q9QZ28 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Six6Q9QZ28 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Six6Q9QZ28 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Six6Q9QZ28 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Six6Q9QZ28 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Six6Q9QZ28 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Six6Q9QZ28 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Six6Q9QZ28 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Six6Q9QZ28 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Six6Q9QZ28 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Six6Q9QZ28 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Six6Q9QZ28 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Six6Q9QZ28 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Six6Q9QZ28 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Six6Q9QZ28 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Six6Q9QZ28 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Six6Q9QZ28 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Six6Q9QZ28 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Six6Q9QZ28 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Six6Q9QZ28 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Six6Q9QZ28 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Six6Q9QZ28 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Six6Q9QZ28 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Six6Q9QZ28 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Six6Q9QZ28 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Six6Q9QZ28 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Six6Q9QZ28 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Six6Q9QZ28 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Six6Q9QZ28 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Six6Q9QZ28 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Six6Q9QZ28 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Six6Q9QZ28 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Six6Q9QZ28 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Six6Q9QZ28 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Six6Q9QZ28 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Six6Q9QZ28 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Six6Q9QZ28 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Six6Q9QZ28 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Six6Q9QZ28 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Six6Q9QZ28 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Six6Q9QZ28 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Six6Q9QZ28 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Six6Q9QZ28 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Six6Q9QZ28 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Six6Q9QZ28 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Six6Q9QZ28 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Six6Q9QZ28 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Six6Q9QZ28 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Six6Q9QZ28 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Six6Q9QZ28 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Six6Q9QZ28 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Six6Q9QZ28 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Six6Q9QZ28 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Six6Q9QZ28 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Six6Q9QZ28 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Six6Q9QZ28 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Six6Q9QZ28 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Six6Q9QZ28 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Six6Q9QZ28 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Six6Q9QZ28 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Six6Q9QZ28 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Six6Q9QZ28 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Six6Q9QZ28 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Six6Q9QZ28 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Six6Q9QZ28 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Six6Q9QZ28 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Six6Q9QZ28 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Six6Q9QZ28 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Six6Q9QZ28 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Six6Q9QZ28 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Six6Q9QZ28 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Six6Q9QZ28 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Six6Q9QZ28 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Six6Q9QZ28 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms