Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYE3

Bcl11a, B-cell lymphoma/leukemia 11A, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11aQ9QYE3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Bcl11aQ9QYE3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Bcl11aQ9QYE3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Bcl11aQ9QYE3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Bcl11aQ9QYE3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Bcl11aQ9QYE3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Bcl11aQ9QYE3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Bcl11aQ9QYE3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Bcl11aQ9QYE3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Bcl11aQ9QYE3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Bcl11aQ9QYE3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Bcl11aQ9QYE3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Bcl11aQ9QYE3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Bcl11aQ9QYE3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Bcl11aQ9QYE3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Bcl11aQ9QYE3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Bcl11aQ9QYE3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Bcl11aQ9QYE3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Bcl11aQ9QYE3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Bcl11aQ9QYE3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Bcl11aQ9QYE3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Bcl11aQ9QYE3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Bcl11aQ9QYE3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Bcl11aQ9QYE3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Bcl11aQ9QYE3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Bcl11aQ9QYE3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Bcl11aQ9QYE3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bcl11aQ9QYE3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bcl11aQ9QYE3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bcl11aQ9QYE3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bcl11aQ9QYE3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bcl11aQ9QYE3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bcl11aQ9QYE3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bcl11aQ9QYE3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Bcl11aQ9QYE3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Bcl11aQ9QYE3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Bcl11aQ9QYE3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Bcl11aQ9QYE3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Bcl11aQ9QYE3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Bcl11aQ9QYE3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Bcl11aQ9QYE3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Bcl11aQ9QYE3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Bcl11aQ9QYE3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Bcl11aQ9QYE3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Bcl11aQ9QYE3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Bcl11aQ9QYE3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Bcl11aQ9QYE3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Bcl11aQ9QYE3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Bcl11aQ9QYE3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Bcl11aQ9QYE3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Bcl11aQ9QYE3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Bcl11aQ9QYE3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Bcl11aQ9QYE3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Bcl11aQ9QYE3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Bcl11aQ9QYE3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Bcl11aQ9QYE3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Bcl11aQ9QYE3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Bcl11aQ9QYE3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Bcl11aQ9QYE3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Bcl11aQ9QYE3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Bcl11aQ9QYE3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Bcl11aQ9QYE3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Bcl11aQ9QYE3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Bcl11aQ9QYE3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Bcl11aQ9QYE3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Bcl11aQ9QYE3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Bcl11aQ9QYE3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Bcl11aQ9QYE3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Bcl11aQ9QYE3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Bcl11aQ9QYE3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Bcl11aQ9QYE3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Bcl11aQ9QYE3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Bcl11aQ9QYE3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Bcl11aQ9QYE3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Bcl11aQ9QYE3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Bcl11aQ9QYE3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Bcl11aQ9QYE3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Bcl11aQ9QYE3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Bcl11aQ9QYE3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Bcl11aQ9QYE3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Bcl11aQ9QYE3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Bcl11aQ9QYE3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Bcl11aQ9QYE3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Bcl11aQ9QYE3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Bcl11aQ9QYE3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Bcl11aQ9QYE3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Bcl11aQ9QYE3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Bcl11aQ9QYE3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Bcl11aQ9QYE3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Bcl11aQ9QYE3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Bcl11aQ9QYE3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Bcl11aQ9QYE3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Bcl11aQ9QYE3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Bcl11aQ9QYE3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Bcl11aQ9QYE3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Bcl11aQ9QYE3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Bcl11aQ9QYE3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Bcl11aQ9QYE3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Bcl11aQ9QYE3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Bcl11aQ9QYE3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 174.3 ms