Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irx4Q9QY61 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irx4Q9QY61 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irx4Q9QY61 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Irx4Q9QY61 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Irx4Q9QY61 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irx4Q9QY61 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irx4Q9QY61 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irx4Q9QY61 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irx4Q9QY61 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irx4Q9QY61 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irx4Q9QY61 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irx4Q9QY61 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irx4Q9QY61 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irx4Q9QY61 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irx4Q9QY61 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Irx4Q9QY61 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Irx4Q9QY61 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Irx4Q9QY61 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Irx4Q9QY61 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Irx4Q9QY61 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Irx4Q9QY61 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Irx4Q9QY61 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Irx4Q9QY61 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Irx4Q9QY61 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Irx4Q9QY61 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Irx4Q9QY61 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Irx4Q9QY61 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Irx4Q9QY61 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Irx4Q9QY61 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Irx4Q9QY61 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Irx4Q9QY61 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Irx4Q9QY61 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Irx4Q9QY61 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Irx4Q9QY61 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Irx4Q9QY61 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Irx4Q9QY61 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Irx4Q9QY61 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Irx4Q9QY61 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Irx4Q9QY61 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Irx4Q9QY61 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Irx4Q9QY61 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Irx4Q9QY61 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Irx4Q9QY61 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Irx4Q9QY61 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Irx4Q9QY61 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Irx4Q9QY61 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Irx4Q9QY61 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Irx4Q9QY61 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Irx4Q9QY61 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Irx4Q9QY61 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Irx4Q9QY61 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Irx4Q9QY61 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Irx4Q9QY61 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irx4Q9QY61 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irx4Q9QY61 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irx4Q9QY61 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irx4Q9QY61 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irx4Q9QY61 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Irx4Q9QY61 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irx4Q9QY61 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irx4Q9QY61 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irx4Q9QY61 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irx4Q9QY61 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Irx4Q9QY61 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irx4Q9QY61 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irx4Q9QY61 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irx4Q9QY61 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irx4Q9QY61 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irx4Q9QY61 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irx4Q9QY61 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irx4Q9QY61 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irx4Q9QY61 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irx4Q9QY61 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irx4Q9QY61 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irx4Q9QY61 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Irx4Q9QY61 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Irx4Q9QY61 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Irx4Q9QY61 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Irx4Q9QY61 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Irx4Q9QY61 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Irx4Q9QY61 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Irx4Q9QY61 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Irx4Q9QY61 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Irx4Q9QY61 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Irx4Q9QY61 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Irx4Q9QY61 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Irx4Q9QY61 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Irx4Q9QY61 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Irx4Q9QY61 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Irx4Q9QY61 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Irx4Q9QY61 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Irx4Q9QY61 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Irx4Q9QY61 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Irx4Q9QY61 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Irx4Q9QY61 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Irx4Q9QY61 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Irx4Q9QY61 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Irx4Q9QY61 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Irx4Q9QY61 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms