Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWT9

Kifc1, Kinesin-like protein KIFC1, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kifc1Q9QWT9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kifc1Q9QWT9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kifc1Q9QWT9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kifc1Q9QWT9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kifc1Q9QWT9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kifc1Q9QWT9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kifc1Q9QWT9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kifc1Q9QWT9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kifc1Q9QWT9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kifc1Q9QWT9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kifc1Q9QWT9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kifc1Q9QWT9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kifc1Q9QWT9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kifc1Q9QWT9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kifc1Q9QWT9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kifc1Q9QWT9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kifc1Q9QWT9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kifc1Q9QWT9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Kifc1Q9QWT9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kifc1Q9QWT9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Kifc1Q9QWT9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kifc1Q9QWT9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kifc1Q9QWT9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kifc1Q9QWT9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kifc1Q9QWT9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kifc1Q9QWT9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kifc1Q9QWT9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kifc1Q9QWT9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kifc1Q9QWT9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kifc1Q9QWT9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kifc1Q9QWT9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kifc1Q9QWT9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kifc1Q9QWT9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kifc1Q9QWT9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kifc1Q9QWT9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kifc1Q9QWT9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kifc1Q9QWT9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Kifc1Q9QWT9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kifc1Q9QWT9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kifc1Q9QWT9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kifc1Q9QWT9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kifc1Q9QWT9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kifc1Q9QWT9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Kifc1Q9QWT9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kifc1Q9QWT9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kifc1Q9QWT9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kifc1Q9QWT9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kifc1Q9QWT9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kifc1Q9QWT9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kifc1Q9QWT9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kifc1Q9QWT9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kifc1Q9QWT9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kifc1Q9QWT9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kifc1Q9QWT9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kifc1Q9QWT9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kifc1Q9QWT9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kifc1Q9QWT9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kifc1Q9QWT9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kifc1Q9QWT9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Kifc1Q9QWT9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kifc1Q9QWT9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kifc1Q9QWT9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kifc1Q9QWT9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kifc1Q9QWT9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kifc1Q9QWT9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kifc1Q9QWT9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kifc1Q9QWT9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Kifc1Q9QWT9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Kifc1Q9QWT9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Kifc1Q9QWT9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kifc1Q9QWT9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kifc1Q9QWT9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kifc1Q9QWT9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kifc1Q9QWT9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kifc1Q9QWT9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kifc1Q9QWT9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kifc1Q9QWT9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kifc1Q9QWT9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kifc1Q9QWT9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kifc1Q9QWT9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kifc1Q9QWT9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kifc1Q9QWT9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kifc1Q9QWT9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kifc1Q9QWT9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kifc1Q9QWT9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kifc1Q9QWT9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kifc1Q9QWT9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kifc1Q9QWT9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kifc1Q9QWT9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kifc1Q9QWT9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kifc1Q9QWT9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kifc1Q9QWT9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kifc1Q9QWT9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kifc1Q9QWT9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kifc1Q9QWT9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kifc1Q9QWT9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kifc1Q9QWT9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kifc1Q9QWT9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kifc1Q9QWT9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kifc1Q9QWT9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms