Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG1

Edf1, Endothelial differentiation-related factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edf1Q9JMG1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Edf1Q9JMG1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Edf1Q9JMG1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Edf1Q9JMG1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Edf1Q9JMG1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Edf1Q9JMG1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Edf1Q9JMG1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Edf1Q9JMG1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Edf1Q9JMG1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Edf1Q9JMG1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Edf1Q9JMG1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Edf1Q9JMG1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Edf1Q9JMG1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Edf1Q9JMG1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Edf1Q9JMG1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Edf1Q9JMG1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Edf1Q9JMG1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Edf1Q9JMG1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Edf1Q9JMG1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Edf1Q9JMG1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Edf1Q9JMG1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Edf1Q9JMG1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Edf1Q9JMG1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Edf1Q9JMG1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Edf1Q9JMG1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Edf1Q9JMG1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Edf1Q9JMG1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Edf1Q9JMG1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Edf1Q9JMG1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Edf1Q9JMG1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Edf1Q9JMG1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Edf1Q9JMG1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Edf1Q9JMG1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Edf1Q9JMG1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Edf1Q9JMG1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Edf1Q9JMG1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Edf1Q9JMG1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Edf1Q9JMG1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Edf1Q9JMG1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Edf1Q9JMG1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Edf1Q9JMG1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Edf1Q9JMG1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Edf1Q9JMG1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Edf1Q9JMG1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Edf1Q9JMG1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Edf1Q9JMG1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Edf1Q9JMG1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Edf1Q9JMG1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Edf1Q9JMG1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Edf1Q9JMG1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Edf1Q9JMG1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Edf1Q9JMG1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Edf1Q9JMG1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Edf1Q9JMG1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Edf1Q9JMG1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Edf1Q9JMG1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Edf1Q9JMG1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Edf1Q9JMG1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Edf1Q9JMG1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Edf1Q9JMG1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Edf1Q9JMG1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Edf1Q9JMG1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Edf1Q9JMG1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Edf1Q9JMG1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Edf1Q9JMG1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Edf1Q9JMG1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Edf1Q9JMG1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Edf1Q9JMG1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Edf1Q9JMG1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Edf1Q9JMG1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Edf1Q9JMG1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Edf1Q9JMG1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Edf1Q9JMG1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Edf1Q9JMG1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Edf1Q9JMG1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Edf1Q9JMG1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Edf1Q9JMG1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Edf1Q9JMG1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Edf1Q9JMG1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Edf1Q9JMG1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Edf1Q9JMG1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Edf1Q9JMG1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Edf1Q9JMG1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Edf1Q9JMG1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Edf1Q9JMG1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Edf1Q9JMG1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Edf1Q9JMG1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Edf1Q9JMG1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Edf1Q9JMG1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Edf1Q9JMG1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Edf1Q9JMG1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Edf1Q9JMG1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Edf1Q9JMG1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Edf1Q9JMG1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Edf1Q9JMG1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Edf1Q9JMG1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Edf1Q9JMG1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Edf1Q9JMG1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Edf1Q9JMG1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Edf1Q9JMG1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms