Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV6

Pnkp, Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnkpQ9JLV6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PnkpQ9JLV6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PnkpQ9JLV6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PnkpQ9JLV6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PnkpQ9JLV6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PnkpQ9JLV6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PnkpQ9JLV6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PnkpQ9JLV6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PnkpQ9JLV6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PnkpQ9JLV6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PnkpQ9JLV6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PnkpQ9JLV6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PnkpQ9JLV6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PnkpQ9JLV6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PnkpQ9JLV6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PnkpQ9JLV6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PnkpQ9JLV6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PnkpQ9JLV6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PnkpQ9JLV6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PnkpQ9JLV6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PnkpQ9JLV6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PnkpQ9JLV6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PnkpQ9JLV6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PnkpQ9JLV6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PnkpQ9JLV6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PnkpQ9JLV6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PnkpQ9JLV6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PnkpQ9JLV6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PnkpQ9JLV6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PnkpQ9JLV6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PnkpQ9JLV6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PnkpQ9JLV6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PnkpQ9JLV6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PnkpQ9JLV6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PnkpQ9JLV6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PnkpQ9JLV6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PnkpQ9JLV6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PnkpQ9JLV6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PnkpQ9JLV6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PnkpQ9JLV6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PnkpQ9JLV6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PnkpQ9JLV6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PnkpQ9JLV6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PnkpQ9JLV6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PnkpQ9JLV6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PnkpQ9JLV6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PnkpQ9JLV6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PnkpQ9JLV6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PnkpQ9JLV6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PnkpQ9JLV6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PnkpQ9JLV6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PnkpQ9JLV6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PnkpQ9JLV6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PnkpQ9JLV6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PnkpQ9JLV6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PnkpQ9JLV6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PnkpQ9JLV6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PnkpQ9JLV6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PnkpQ9JLV6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PnkpQ9JLV6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PnkpQ9JLV6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PnkpQ9JLV6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PnkpQ9JLV6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PnkpQ9JLV6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PnkpQ9JLV6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PnkpQ9JLV6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
PnkpQ9JLV6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PnkpQ9JLV6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PnkpQ9JLV6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PnkpQ9JLV6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PnkpQ9JLV6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PnkpQ9JLV6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PnkpQ9JLV6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PnkpQ9JLV6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PnkpQ9JLV6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PnkpQ9JLV6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PnkpQ9JLV6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PnkpQ9JLV6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PnkpQ9JLV6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PnkpQ9JLV6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PnkpQ9JLV6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PnkpQ9JLV6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PnkpQ9JLV6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PnkpQ9JLV6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PnkpQ9JLV6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PnkpQ9JLV6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PnkpQ9JLV6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PnkpQ9JLV6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PnkpQ9JLV6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PnkpQ9JLV6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PnkpQ9JLV6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PnkpQ9JLV6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PnkpQ9JLV6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PnkpQ9JLV6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PnkpQ9JLV6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PnkpQ9JLV6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PnkpQ9JLV6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PnkpQ9JLV6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PnkpQ9JLV6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PnkpQ9JLV6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 153.9 ms