Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL16

Isg20, Interferon-stimulated gene 20 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Isg20Q9JL16 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Isg20Q9JL16 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Isg20Q9JL16 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Isg20Q9JL16 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Isg20Q9JL16 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Isg20Q9JL16 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Isg20Q9JL16 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Isg20Q9JL16 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Isg20Q9JL16 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Isg20Q9JL16 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Isg20Q9JL16 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Isg20Q9JL16 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Isg20Q9JL16 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Isg20Q9JL16 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Isg20Q9JL16 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Isg20Q9JL16 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Isg20Q9JL16 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Isg20Q9JL16 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Isg20Q9JL16 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Isg20Q9JL16 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Isg20Q9JL16 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Isg20Q9JL16 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Isg20Q9JL16 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Isg20Q9JL16 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Isg20Q9JL16 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Isg20Q9JL16 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Isg20Q9JL16 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Isg20Q9JL16 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Isg20Q9JL16 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Isg20Q9JL16 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Isg20Q9JL16 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Isg20Q9JL16 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Isg20Q9JL16 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Isg20Q9JL16 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Isg20Q9JL16 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Isg20Q9JL16 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Isg20Q9JL16 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Isg20Q9JL16 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Isg20Q9JL16 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Isg20Q9JL16 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Isg20Q9JL16 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Isg20Q9JL16 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Isg20Q9JL16 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Isg20Q9JL16 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Isg20Q9JL16 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Isg20Q9JL16 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Isg20Q9JL16 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Isg20Q9JL16 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Isg20Q9JL16 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Isg20Q9JL16 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Isg20Q9JL16 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Isg20Q9JL16 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Isg20Q9JL16 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Isg20Q9JL16 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Isg20Q9JL16 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Isg20Q9JL16 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Isg20Q9JL16 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Isg20Q9JL16 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Isg20Q9JL16 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Isg20Q9JL16 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Isg20Q9JL16 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Isg20Q9JL16 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Isg20Q9JL16 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Isg20Q9JL16 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Isg20Q9JL16 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Isg20Q9JL16 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Isg20Q9JL16 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Isg20Q9JL16 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Isg20Q9JL16 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Isg20Q9JL16 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Isg20Q9JL16 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Isg20Q9JL16 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Isg20Q9JL16 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Isg20Q9JL16 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Isg20Q9JL16 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Isg20Q9JL16 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Isg20Q9JL16 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Isg20Q9JL16 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Isg20Q9JL16 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Isg20Q9JL16 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Isg20Q9JL16 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Isg20Q9JL16 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Isg20Q9JL16 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Isg20Q9JL16 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Isg20Q9JL16 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Isg20Q9JL16 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Isg20Q9JL16 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Isg20Q9JL16 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Isg20Q9JL16 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Isg20Q9JL16 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Isg20Q9JL16 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Isg20Q9JL16 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Isg20Q9JL16 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Isg20Q9JL16 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Isg20Q9JL16 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Isg20Q9JL16 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Isg20Q9JL16 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Isg20Q9JL16 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Isg20Q9JL16 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Isg20Q9JL16 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 192.4 ms