Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS3

Smco4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco4Q9JIS3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smco4Q9JIS3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smco4Q9JIS3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smco4Q9JIS3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smco4Q9JIS3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smco4Q9JIS3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smco4Q9JIS3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smco4Q9JIS3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smco4Q9JIS3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smco4Q9JIS3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smco4Q9JIS3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms