Protein–RNA interactions for Protein: Q9JID9

Sh2b2, SH2B adapter protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2b2Q9JID9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sh2b2Q9JID9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sh2b2Q9JID9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sh2b2Q9JID9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sh2b2Q9JID9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sh2b2Q9JID9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sh2b2Q9JID9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sh2b2Q9JID9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sh2b2Q9JID9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sh2b2Q9JID9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Sh2b2Q9JID9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh2b2Q9JID9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh2b2Q9JID9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh2b2Q9JID9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh2b2Q9JID9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh2b2Q9JID9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh2b2Q9JID9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh2b2Q9JID9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh2b2Q9JID9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh2b2Q9JID9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh2b2Q9JID9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh2b2Q9JID9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh2b2Q9JID9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh2b2Q9JID9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh2b2Q9JID9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh2b2Q9JID9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh2b2Q9JID9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh2b2Q9JID9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh2b2Q9JID9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh2b2Q9JID9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sh2b2Q9JID9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sh2b2Q9JID9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sh2b2Q9JID9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sh2b2Q9JID9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Sh2b2Q9JID9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sh2b2Q9JID9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sh2b2Q9JID9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sh2b2Q9JID9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sh2b2Q9JID9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sh2b2Q9JID9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sh2b2Q9JID9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sh2b2Q9JID9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sh2b2Q9JID9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sh2b2Q9JID9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Sh2b2Q9JID9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sh2b2Q9JID9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sh2b2Q9JID9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sh2b2Q9JID9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sh2b2Q9JID9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sh2b2Q9JID9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sh2b2Q9JID9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sh2b2Q9JID9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sh2b2Q9JID9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sh2b2Q9JID9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sh2b2Q9JID9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sh2b2Q9JID9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sh2b2Q9JID9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sh2b2Q9JID9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sh2b2Q9JID9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sh2b2Q9JID9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sh2b2Q9JID9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sh2b2Q9JID9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sh2b2Q9JID9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sh2b2Q9JID9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sh2b2Q9JID9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sh2b2Q9JID9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Sh2b2Q9JID9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sh2b2Q9JID9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sh2b2Q9JID9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Sh2b2Q9JID9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Sh2b2Q9JID9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sh2b2Q9JID9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sh2b2Q9JID9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sh2b2Q9JID9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sh2b2Q9JID9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sh2b2Q9JID9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sh2b2Q9JID9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sh2b2Q9JID9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sh2b2Q9JID9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sh2b2Q9JID9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sh2b2Q9JID9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sh2b2Q9JID9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sh2b2Q9JID9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sh2b2Q9JID9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sh2b2Q9JID9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sh2b2Q9JID9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sh2b2Q9JID9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sh2b2Q9JID9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sh2b2Q9JID9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sh2b2Q9JID9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sh2b2Q9JID9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sh2b2Q9JID9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sh2b2Q9JID9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sh2b2Q9JID9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sh2b2Q9JID9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sh2b2Q9JID9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sh2b2Q9JID9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sh2b2Q9JID9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sh2b2Q9JID9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sh2b2Q9JID9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms