Protein–RNA interactions for Protein: Q9D742

Ap5s1, AP-5 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap5s1Q9D742 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ap5s1Q9D742 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms