Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y1

Ccdc3, Coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc3Q9D6Y1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc3Q9D6Y1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc3Q9D6Y1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc3Q9D6Y1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc3Q9D6Y1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc3Q9D6Y1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc3Q9D6Y1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc3Q9D6Y1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc3Q9D6Y1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc3Q9D6Y1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc3Q9D6Y1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc3Q9D6Y1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc3Q9D6Y1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc3Q9D6Y1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc3Q9D6Y1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc3Q9D6Y1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc3Q9D6Y1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc3Q9D6Y1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc3Q9D6Y1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc3Q9D6Y1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc3Q9D6Y1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc3Q9D6Y1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc3Q9D6Y1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc3Q9D6Y1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc3Q9D6Y1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc3Q9D6Y1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc3Q9D6Y1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc3Q9D6Y1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc3Q9D6Y1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc3Q9D6Y1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc3Q9D6Y1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc3Q9D6Y1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc3Q9D6Y1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc3Q9D6Y1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc3Q9D6Y1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc3Q9D6Y1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc3Q9D6Y1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc3Q9D6Y1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc3Q9D6Y1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc3Q9D6Y1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc3Q9D6Y1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc3Q9D6Y1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc3Q9D6Y1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc3Q9D6Y1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc3Q9D6Y1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc3Q9D6Y1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc3Q9D6Y1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc3Q9D6Y1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc3Q9D6Y1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc3Q9D6Y1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc3Q9D6Y1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc3Q9D6Y1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc3Q9D6Y1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc3Q9D6Y1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc3Q9D6Y1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc3Q9D6Y1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc3Q9D6Y1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc3Q9D6Y1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc3Q9D6Y1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.7
Ccdc3Q9D6Y1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc3Q9D6Y1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc3Q9D6Y1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc3Q9D6Y1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc3Q9D6Y1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc3Q9D6Y1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc3Q9D6Y1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc3Q9D6Y1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc3Q9D6Y1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc3Q9D6Y1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc3Q9D6Y1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc3Q9D6Y1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc3Q9D6Y1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc3Q9D6Y1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc3Q9D6Y1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc3Q9D6Y1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc3Q9D6Y1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc3Q9D6Y1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc3Q9D6Y1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc3Q9D6Y1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc3Q9D6Y1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc3Q9D6Y1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc3Q9D6Y1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc3Q9D6Y1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc3Q9D6Y1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc3Q9D6Y1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc3Q9D6Y1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc3Q9D6Y1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc3Q9D6Y1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc3Q9D6Y1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc3Q9D6Y1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc3Q9D6Y1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc3Q9D6Y1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc3Q9D6Y1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc3Q9D6Y1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc3Q9D6Y1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc3Q9D6Y1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc3Q9D6Y1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc3Q9D6Y1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc3Q9D6Y1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc3Q9D6Y1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms