Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I3

Pfn4, Profilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn4Q9D6I3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pfn4Q9D6I3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pfn4Q9D6I3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Pfn4Q9D6I3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Pfn4Q9D6I3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pfn4Q9D6I3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pfn4Q9D6I3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Pfn4Q9D6I3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pfn4Q9D6I3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pfn4Q9D6I3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pfn4Q9D6I3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pfn4Q9D6I3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Pfn4Q9D6I3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pfn4Q9D6I3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pfn4Q9D6I3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pfn4Q9D6I3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pfn4Q9D6I3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pfn4Q9D6I3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Pfn4Q9D6I3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pfn4Q9D6I3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pfn4Q9D6I3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pfn4Q9D6I3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pfn4Q9D6I3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pfn4Q9D6I3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pfn4Q9D6I3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pfn4Q9D6I3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pfn4Q9D6I3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pfn4Q9D6I3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Pfn4Q9D6I3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pfn4Q9D6I3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pfn4Q9D6I3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pfn4Q9D6I3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pfn4Q9D6I3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pfn4Q9D6I3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pfn4Q9D6I3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pfn4Q9D6I3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pfn4Q9D6I3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pfn4Q9D6I3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pfn4Q9D6I3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pfn4Q9D6I3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pfn4Q9D6I3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pfn4Q9D6I3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pfn4Q9D6I3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pfn4Q9D6I3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pfn4Q9D6I3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pfn4Q9D6I3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pfn4Q9D6I3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pfn4Q9D6I3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pfn4Q9D6I3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pfn4Q9D6I3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pfn4Q9D6I3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pfn4Q9D6I3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pfn4Q9D6I3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pfn4Q9D6I3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pfn4Q9D6I3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pfn4Q9D6I3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Pfn4Q9D6I3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pfn4Q9D6I3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pfn4Q9D6I3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pfn4Q9D6I3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pfn4Q9D6I3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pfn4Q9D6I3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pfn4Q9D6I3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pfn4Q9D6I3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pfn4Q9D6I3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pfn4Q9D6I3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pfn4Q9D6I3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pfn4Q9D6I3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pfn4Q9D6I3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pfn4Q9D6I3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pfn4Q9D6I3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pfn4Q9D6I3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pfn4Q9D6I3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pfn4Q9D6I3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pfn4Q9D6I3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pfn4Q9D6I3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pfn4Q9D6I3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pfn4Q9D6I3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pfn4Q9D6I3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pfn4Q9D6I3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pfn4Q9D6I3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pfn4Q9D6I3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pfn4Q9D6I3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pfn4Q9D6I3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pfn4Q9D6I3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pfn4Q9D6I3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pfn4Q9D6I3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pfn4Q9D6I3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pfn4Q9D6I3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pfn4Q9D6I3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pfn4Q9D6I3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pfn4Q9D6I3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pfn4Q9D6I3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pfn4Q9D6I3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pfn4Q9D6I3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pfn4Q9D6I3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pfn4Q9D6I3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pfn4Q9D6I3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pfn4Q9D6I3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pfn4Q9D6I3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms